我用Rstudio ODBC 64连接第一个MySQL,的数据库成功,
但连本地的MySQL 里的数据库不成功。
不知道我本地MySQL缺啥
Rstudio ODBC 连接MySQL
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- dabocaiqq 2018-07-13 02:02关注
一、使用Rstudio连接mysql数据库
我们常常会把大量的数据存储在MySQL这样的数据库中,这样方便我们进行数据提取和操作,而很多时候当我们在用R进行数据分析的时候,通常都希望R能够直接和mysql数据库连接,方便我们直接对大规模数据进行处理。当然,mysql中存储的是结构化数据。
有些朋友在使用R连接mysql等数据库的时候会遇到一些问题,因而本文着重以mysql为例,介绍如何利用R连接mysql数据源的基本步骤。具体步骤如下:
1、R下载RODBC包,安装好。
install packages("RODBC"); #安装RODBC包
2、打开链接 http://dev.mysql.com/downloads/connector/odbc,下载mySQL ODBC,安装好:
3、控制面板--->管理工具--->数据源(ODBC)(根据电脑选择32位、64位)--->点击添加--->选中mysql ODBC driver选项(Unicode和ANSI任意选择一个)。
data source name(DSN数据源名称)填入你想要使用的名字,例如:mysql_data;
description 可以随意填写,例如mydata
TCP/IP Server 本机服务器IP,一般为:127.0.0.1或者localhost
user 你的mysql用户名
password 你的mysql密码
然后数据库里会出现你的mysql里的所有数据库,选择一个数据库。
4、打开R的界面调用数据库:(本人使用的是RStudio)
(1)library(RODBC);(2)channel <- odbcConnect("mysql_data", uid="root", pwd="123456");
(3)sqlTables(channel); #查看数据库中的表
(4)data<-sqlFetch(channel,"titanicdata"); # 将表titanicdata的内容,存到数据框data里
5、至此,R已经成功与mysql数据库连接,并且获取了mysql库中niesheng数据库里titanicdata表中的数据。
6、既然能够连接上数据库,那么在R中同样可以使用SQL语句进行数据处理和数据提取。
例1:将年龄不为空的数据存入data1数据集中。
data1 <- sqlQuery(channel, "selectsurvived, age, class, sex from titanicdata where age<> 'null';
例2:将是否幸存survived、阶级class、性别sex 都转换为1、0这样的数值,便于后面进行分析。
Titanic <- sqlQuery(channel, "select (CASE WHEN t.survived='yes' THEN 1 ELSE 0 END) survived, age,(case when t.class='1st' then 1 when t.class='2st' then 2 else 3 end) class,
(case when t.sex='male' then 1 else 0 end) sex from titanicdata t where age<> 'null' ORDER BY survived,age;");
7、R不仅可以连接mysql,还能连接其他数据源,包括Access、Excel、SQLServer数据库等。具体可以参考R中的odbcConnect的具体用法。
二、 安装RODBC库
1、进入R语言的GUI界面(RGUI.EXE),在菜单栏选择“程序包/安装程序包”
2、在弹出的窗口里往下拉,选择RODBC如图,点击确定
3、在ODBC数据源管理器里将需要的数据库添加进去,这里笔者使用的是SQL Server2008,驱动程序选择Native Client10.04、在R语言窗口输入连接语句
library(RODBC)
**这里是载入RODBC库
channel<-odbcConnect("MyTest",uid="ripley",case="tolower")
**连接刚才添加进数据源的“MyTest”数据库
ch <- odbcConnect("some dsn ", uid = "user ", pwd = "** ")
表示用户名为user,密码是**,如果没有设置,可以直接忽略
data(USArrests)
**将“USArrests”表写进数据库里(这个表是R自带的)
sqlSave(channel,USArrests,rownames = "state",addPK = TRUE)
**将数据流保存,这时候打开SQL Server就可以看到新建的USArrests表了
rm(USArrests)
sqlTables(channel)
**给出数据库中的表
sqlFetch(channel,"USArrests",rownames = "state")
**输出USArrests表中的内容
sqlQuery(channel,"select * from USArrests")
**调用SELECT查询语句并返回结果(如图)
sqlDrop(channel,"USArrests")
**删除表
odbcClose(channel)
**最后要记得关闭连接
当然,通过这个办法也可以读取Excel、Access表中的内容,具体方法类似,这里不再重复
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