nancy5555543 2019-07-17 21:09 采纳率: 0%
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qiime2 导入fastq数据报错:

各位大佬好,这里是qiime2 萌新小白提问,望各位大佬多多指教。

背景:16S测序,公司返回已切除barcode及引物的双端数据(Miseq测序得到的是PE300双端序列数据),现需要在qiime2里 import data

数据格式:

图片说明

我自己制作的manifest文件:
图片说明

注:data是我存放测序数据的文件夹

代码:
qiime tools import \

--type 'SampleData[PairedEndSequencesWithQuality]' \

--input-path se-33-manifest.csv \

--output-path paired-end-demux.qza \

--source-format PairedEndFastqManifestPhred33

报错:

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多谢指导!!

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