qq_48504614 2023-04-23 13:48 采纳率: 100%
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请问这种代码可以在哪个软件中实现呢?

是用来筛选不同组之间高表达基因的代码,好像不是用R实现的,或许有人知道怎么用吗

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  • 喝茶品人生 2023-04-23 13:59
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    **r语言貌似也能做,下面是我用py实现的一个例子:
    import pandas as pd
    df = pd.read_csv('你的文件读取路径')
    groups = df.groupby('group')
    for name, group in groups:
        mean_expr = group.mean(axis=0)
        diff_expr = mean_expr - groups.mean().mean()
        threshold = 1.5
        high_expr_genes = diff_expr[diff_expr > threshold].index.tolist()
        print(f"High expression genes in group {name}: {', '.join(high_expr_genes)}")
    
    
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