irises_heaven 2020-01-21 14:59 采纳率: 0%
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blastn跑完后的结果的那一串数字、字母都代表什么。

blastn跑完后的结果的那一串数字、字母都代表什么?
(已查过百度,但是出来的都是执行blastn时那些代码dai'biao's'm

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1条回答

  • Pipiminidou 2021-10-14 17:37
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    你blastn的结果出来的应该是outfmt #6, 从左到右代表的应该是:
    qseqid: 查询序列的命名id
    sseqid: 目标序列的命名id
    pident: 匹配度的百分比
    length: 查询序列和目标序列的匹配长度
    mismatch: 错配的数目
    gapopen: gap的数目
    qstart: 查询序列开始位置
    qend: 查询序列结束位置
    sstart: 目标序列开始位置
    send: 目标序列结束位置
    evalue: 期望值
    bitscore: bit得分

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