asp.net做网站新建项目web空应用程序还是新建网站

Question

小弟刚出来工作，第一个项目是建的asp.net空网站，但是在发布网站的时候会把每个bin文件里的每个cs类文件生成一个随机命名的dll文件，网站上线后，如果有些功能要修改cs文件的话，就很麻烦，要重新上传所有的内容，听说新建web应用程序就不会有这个问题，web应用程序会把cs文件封装在一个dll里面，是这样吗？这些我都还不是很懂，做网站的话是新建哪个好点，各自有什么优缺点？希望前辈们指教一下，万分感谢。