Java对owl文件的解析和增删改查该如何实现？

Question

最近在做一个项目，我们构建本体之前一直用protege这个软件，构建出来的.owl文件格式是固定的，于是乎项目经理的意思是我们自己对.owl文件进行修改就好没必要非得依赖这个protege（原因就是生成的格式是固定的）。但是想对这个.owl文件进行修改就得解析出里面的类，概念，对象属性，数据属性等内容，我想问，有哪个大神做过这方面的工作，给点建议或者方法啥的参考下。或者类似的对.owl文件的增删改查的方法提供参考参考。小弟不胜感激呀！
追加：这个.owl文件的类，概念，对象属性，数据属性等内容我用其他方法分离出来了。
抛开上面这个问题，我想问：SPARQL语言可以根据“类”查询出该“类”下的所有“个体实例”么？（除了用流的方法去读取.owl文件让后匹配相应字段，再提取。。），有什么现成的查询语句可以用么？

Answer 1

http://www.pudn.com/downloads392/sourcecode/java/detail1677250.html
http://download.csdn.net/detail/mfkmh/4623317