呵呵哒12138 2018-07-31 04:01 采纳率: 40%
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已结题

将VCF转换为基因流动分析(Treemix)所需文件出现问题

我用以下流程进行分析:

vcftools --gzvcf  DK.vcf.gz  --plink-tped --out DK
plink --tfile DK --aec --chr-set 31 --freq --noweb --missing --within pop.cov
gzip plink.frq
plink2treemix.py plink.frq.gz treemix.frq.gz

vcftools和plink的流程都没有报错,但plink的结果是plink.frq.strat,与plink.frq不一样,我按照接下来的流程进行分析,但plink2treemix.py的运行结果treemix.frq.gz的**文件大小却是0**,这是什么原因呢,求指导,万分感谢。

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1条回答

  • devmiao 2018-07-31 15:45
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