在R中调用MHadaptive包,程序编写出错,求助大神!!!

想在R中实现MCMC的MH算法,找到了MHadaptive包,编写出错。
请问各位大神,在R中是否有其他软件包可以实现MH算法?
求助!

报错为:
Error in li_func(pars, ...) :
unused argument (data = c(13.7168018290208, 2.43176602816527, 10.6765122358815, 15.80358874191, 10.655111449607, -0.195113438451521, 9.6881120593819, 7.72980937745959, 7.42310548938604, 19.7701556113501, 10.7819843821222, 1.83165668335545, 7.60799811728853, 13.8245824558228, 11.0861739773354, 9.87726274886303, 17.8636649924113, 2.8819392145203, 16.949557719703, 14.4423595833012, 23.7879576928322, 14.6814611887133, -7.00768217378476, 1.43957354763575, 0.433094981924043, 14.041879238363, 3.29644328179122,
-5.86551090632578, 0.575169549454536, 6.57002104215313, -7.7726064851087, 11.9942852811918, 5.32637319821304, 5.16529291598935, 17.6351408031294, 16.3909043574436, 21.54023028995, 21.5890958946679, -1.90624858968057, -2.01115126785469, 8.46778703917611, 12.0472208530146, 1.49937266390884, 0.217428318422499, 13.4581775358992, 4.60304879819332, 5.6767169446721, 10.2855181990085, 10.773416663384, 19.5509395698454, 7.7176598401012, -2.61488375161332, 5.70273803412963, 9.676768488

程序如下:
library(MHadaptive)
##各侧面水平数
pnum<-100
inum<-20
##方差分量参数值
var<-c(4,16,64)
##产生多少批数据
iter=1
##储存方差分量、标准误、置信区间和覆盖率
inmc.vc<-array(0,dim=c(iter,length(var)))
inmc.se<-array(0,dim=c(iter,length(var)))
inmc.ci50<-array(0,dim=c(iter,length(var)))
inmc.ci950<-array(0,dim=c(iter,length(var)))
inmc.cover<-array(0,dim=c(iter,length(var)))
#定义似然函数
likelihood <- function(param){
sigma_p<-param[1]
sigma_i<-param[2]
sigma_pi<-param[3]
mu<-array(data = 0, dim = c(p_num,i_num))
log_likelihood<-array(data = 0, dim = c(p_num,i_num))
P<-rnorm(n = p_num, mean = 0, sd = sigma_p)
I<-rnorm(n = i_num, mean = 0, sd = sigma_i)
for (p in 1:p_num) {
for (i in 1:i_num) {
mu[p,i]<-P[p]+I[i]
log_likelihood[p,i]<-dnorm(x = x[p,i], mean = mu[p,i], sd = sigma_pi, log = T)
}
}
sigma_p2<-sigma_p^2
sigma_i2<-sigma_i^2
sigma_pi2<-sigma_pi^2
log_likelihood<-sum(log_likelihood)
return(log_likelihood + prior)
}
#定义先验分布
prior <- function(param){
sigma_p<-param[1]
sigma_i<-param[2]
sigma_pi<-param[3]
prior_sigma_p<-dgamma(sigma_p,2,1/4,log=TRUE)
prior_sigma_i<-dgamma(sigma_i,2,1/16,log=TRUE)
prior_sigma_pi<-dgamma(sigma_pi,2,1/64,log=TRUE)
return(prior_sigma_p + prior_sigma_i + prior_sigma_pi)
}
##模拟正态分布的数据
file_path1<-"C:/Users/Administrator/Desktop/infmc/pi/data/data_"
for (k in 1:iter){
pz<-rnorm(pnum,0,(var[1])^0.5)
iz<-rnorm(inum,0,(var[2])^0.5)
piz<-array(rnorm((pnum*inum),0,(var[3])^0.5),dim=c(pnum,inum))
d<-array(0,dim=c(pnum,inum))
for(p in 1:pnum){
for(i in 1:inum){
d[p,i]<-0+pz[p]+iz[i]+piz[p,i]
}
}
write.csv(d,file=paste(file_path1,k,".csv",sep = ""),row.names = F )
##MCMC方法(有信息先验)
mcmc_r<-Metro_Hastings(li_func=likelihood,pars=c(0.01,0.01,0.01),
par_names=c('varp','vari','vare'),iterations = 10000, burn_in = 5000,
adapt_par = c(5000, 20, 0.5, 0.75),data=d)
result<-BCI(mcmc_r, interval = c(0.05, 0.95))
plotMH(mcmc_r)
inmc.vc[k,]<-result[1:3,3]
inmc.ci50[k,]<-result[1:3,1]
inmc.ci950[k,]<-result[1:3,2]
inmc.cover[k,]<-ifelse(inmc.ci50[k,]<var&var<inmc.ci950[k,],1,0)
}

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据羊城晚报报道,近日中芯国际从荷兰进口的一台大型光刻机,顺利通过深圳出口加工区场站两道闸口进入厂区,中芯国际发表公告称该光刻机并非此前盛传的EUV光刻机,主要用于企业复工复产后的生产线扩容。 我们知道EUV主要用于7nm及以下制程的芯片制造,光刻机作为集成电路制造中最关键的设备,对芯片制作工艺有着决定性的影响,被誉为“超精密制造技术皇冠上的明珠”,根据之前中芯国际的公报,目...

优雅的替换if-else语句

场景 日常开发,if-else语句写的不少吧??当逻辑分支非常多的时候,if-else套了一层又一层,虽然业务功能倒是实现了,但是看起来是真的很不优雅,尤其是对于我这种有强迫症的程序"猿",看到这么多if-else,脑袋瓜子就嗡嗡的,总想着解锁新姿势:干掉过多的if-else!!!本文将介绍三板斧手段: 优先判断条件,条件不满足的,逻辑及时中断返回; 采用策略模式+工厂模式; 结合注解,锦...

离职半年了,老东家又发 offer,回不回?

有小伙伴问松哥这个问题,他在上海某公司,在离职了几个月后,前公司的领导联系到他,希望他能够返聘回去,他很纠结要不要回去? 俗话说好马不吃回头草,但是这个小伙伴既然感到纠结了,我觉得至少说明了两个问题:1.曾经的公司还不错;2.现在的日子也不是很如意。否则应该就不会纠结了。 老实说,松哥之前也有过类似的经历,今天就来和小伙伴们聊聊回头草到底吃不吃。 首先一个基本观点,就是离职了也没必要和老东家弄的苦...

2020阿里全球数学大赛:3万名高手、4道题、2天2夜未交卷

阿里巴巴全球数学竞赛( Alibaba Global Mathematics Competition)由马云发起,由中国科学技术协会、阿里巴巴基金会、阿里巴巴达摩院共同举办。大赛不设报名门槛,全世界爱好数学的人都可参与,不论是否出身数学专业、是否投身数学研究。 2020年阿里巴巴达摩院邀请北京大学、剑桥大学、浙江大学等高校的顶尖数学教师组建了出题组。中科院院士、美国艺术与科学院院士、北京国际数学...

为什么你不想学习?只想玩?人是如何一步一步废掉的

不知道是不是只有我这样子,还是你们也有过类似的经历。 上学的时候总有很多光辉历史,学年名列前茅,或者单科目大佬,但是虽然慢慢地长大了,你开始懈怠了,开始废掉了。。。 什么?你说不知道具体的情况是怎么样的? 我来告诉你: 你常常潜意识里或者心理觉得,自己真正的生活或者奋斗还没有开始。总是幻想着自己还拥有大把时间,还有无限的可能,自己还能逆风翻盘,只不是自己还没开始罢了,自己以后肯定会变得特别厉害...

百度工程师,获利10万,判刑3年!

所有一夜暴富的方法都写在刑法中,但总有人心存侥幸。这些年互联网犯罪高发,一些工程师高技术犯罪更是引发关注。这两天,一个百度运维工程师的案例传遍朋友圈。1...

程序员为什么千万不要瞎努力?

本文作者用对比非常鲜明的两个开发团队的故事,讲解了敏捷开发之道 —— 如果你的团队缺乏统一标准的环境,那么即使勤劳努力,不仅会极其耗时而且成果甚微,使用...

为什么程序员做外包会被瞧不起?

二哥,有个事想询问下您的意见,您觉得应届生值得去外包吗?公司虽然挺大的,中xx,但待遇感觉挺低,马上要报到,挺纠结的。

当HR压你价,说你只值7K,你该怎么回答?

当HR压你价,说你只值7K时,你可以流畅地回答,记住,是流畅,不能犹豫。 礼貌地说:“7K是吗?了解了。嗯~其实我对贵司的面试官印象很好。只不过,现在我的手头上已经有一份11K的offer。来面试,主要也是自己对贵司挺有兴趣的,所以过来看看……”(未完) 这段话主要是陪HR互诈的同时,从公司兴趣,公司职员印象上,都给予对方正面的肯定,既能提升HR的好感度,又能让谈判气氛融洽,为后面的发挥留足空间。...

面试:第十六章:Java中级开发(16k)

HashMap底层实现原理,红黑树,B+树,B树的结构原理 Spring的AOP和IOC是什么?它们常见的使用场景有哪些?Spring事务,事务的属性,传播行为,数据库隔离级别 Spring和SpringMVC,MyBatis以及SpringBoot的注解分别有哪些?SpringMVC的工作原理,SpringBoot框架的优点,MyBatis框架的优点 SpringCould组件有哪些,他们...

面试阿里p7,被按在地上摩擦,鬼知道我经历了什么?

面试阿里p7被问到的问题(当时我只知道第一个):@Conditional是做什么的?@Conditional多个条件是什么逻辑关系?条件判断在什么时候执...

无代码时代来临,程序员如何保住饭碗?

编程语言层出不穷,从最初的机器语言到如今2500种以上的高级语言,程序员们大呼“学到头秃”。程序员一边面临编程语言不断推陈出新,一边面临由于许多代码已存在,程序员编写新应用程序时存在重复“搬砖”的现象。 无代码/低代码编程应运而生。无代码/低代码是一种创建应用的方法,它可以让开发者使用最少的编码知识来快速开发应用程序。开发者通过图形界面中,可视化建模来组装和配置应用程序。这样一来,开发者直...

面试了一个 31 岁程序员,让我有所触动,30岁以上的程序员该何去何从?

最近面试了一个31岁8年经验的程序猿,让我有点感慨,大龄程序猿该何去何从。

大三实习生,字节跳动面经分享,已拿Offer

说实话,自己的算法,我一个不会,太难了吧

程序员垃圾简历长什么样?

已经连续五年参加大厂校招、社招的技术面试工作,简历看的不下于万份 这篇文章会用实例告诉你,什么是差的程序员简历! 疫情快要结束了,各个公司也都开始春招了,作为即将红遍大江南北的新晋UP主,那当然要为小伙伴们做点事(手动狗头)。 就在公众号里公开征简历,义务帮大家看,并一一点评。《启舰:春招在即,义务帮大家看看简历吧》 一石激起千层浪,三天收到两百多封简历。 花光了两个星期的所有空闲时...

《Oracle Java SE编程自学与面试指南》最佳学习路线图2020年最新版(进大厂必备)

正确选择比瞎努力更重要!

字节跳动面试官竟然问了我JDBC?

轻松等回家通知

面试官:你连SSO都不懂,就别来面试了

大厂竟然要考我SSO,卧槽。

实时更新:计算机编程语言排行榜—TIOBE世界编程语言排行榜(2020年6月份最新版)

内容导航: 1、TIOBE排行榜 2、总榜(2020年6月份) 3、本月前三名 3.1、C 3.2、Java 3.3、Python 4、学习路线图 5、参考地址 1、TIOBE排行榜 TIOBE排行榜是根据全世界互联网上有经验的程序员、课程和第三方厂商的数量,并使用搜索引擎(如Google、Bing、Yahoo!)以及Wikipedia、Amazon、YouTube统计出排名数据。

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