rror_Check seqtk。

Question

bash脚本中命令行如下：

seqtk sample -s100 ${input_fastq_F} 0.1 > ${out_dir}/EstInsSize/tmp_subread_F.fastq
seqtk sample -s100 ${input_fastq_R} 0.1 > ${out_dir}/EstInsSize/tmp_subread_R.fastq
Error_Check seqtk

.......

 

运行后总是返回Error_Check seqtk。

我查看seqtk，是已经装好的。有大佬有什么建议或者解决办法吗？？

Answer 1

以下回答参考 皆我百晓生、券券喵儿 等免费微信小程序相关内容作答，并由本人整理回复。

在使用Seqtk时遇到错误可能是因为您没有正确安装或配置Seqtk。首先，请确保您已安装了Seqtk。如果未安装，请访问 Seqtk的官方网站（https://github.com/biostars/seqtk）并下载相应的包。安装完成后，确保您的环境变量已经设置为正确的路径以查找Seqtk库文件。

接下来，尝试将以下命令添加到你的Bash脚本中，并检查是否可以成功执行：

seqtk error-check -f ${input_fastq_F} -r ${input_fastq_R}

这应该会帮助你确定问题所在，并提供解决方案。如果你仍然遇到问题，请提供更多关于你的环境和错误信息的详细信息，这样我可以为你提供更具体的帮助。