ZZHloveYF 2021-05-25 22:19 采纳率: 0%
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MMPBSA最终计算出错:prmtoperror,大佬求救

MMPBSA.py -O -i mmpbsa.in -o FINAL_RESULTS_MMPBSA.dat -sp com_wat.prmtop -cp com.prmtop -rp rec.prmtop -lp lig.prmtop -y ../prod3.mdcrd -do decomp.dat -eo energy.csv -deo dec_energies.csv &
这是我运行的命令
出错信息如下:
Reading command-line arguments and input files...
Loading and checking parameter files for compatibility...
PrmtopError: Complex natom != receptor natom + ligand natom
Exiting. All files have been retained.

 

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2条回答 默认 最新

  • lby_new 2021-06-10 11:44
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    这是说复合物的原子数应该等于受体和配体的原子数总和吧?楼主解决这个问题了吗?我也遇到了同样的问题。。。自认处理pdb文件也没啥问题。。。

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