反叛的杂交水稻 2021-06-24 16:15 采纳率: 0%
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已结题

GEMMA进行GWAS分析加入协变量文件之后报错

进行的是某种植物的GWAS分析，用GEMMA进行LMM+PCA+协变量，加入协变量文件的时候就会报错显示GSL ERROR: matrix is singular in lu.c at line 266 errno 1，去掉协变量文件就可以运行，看了说明手册，有点迷糊，求大神指点迷津……

说明文档里是这么说的

协变量的文件格式是这样的

参考的是邓老师的方法https://blog.csdn.net/yijiaobani/article/details/106220289

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  • 反叛的杂交水稻 2021-06-26 10:56
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    已经解决了，cov文档第一列截距删掉😂

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