请问我使用trinity组装转录组样品时遇见这种报错该如何解决？

Question

求各位大神帮忙看看吧~挺急的

Answer 1

这个报错是因为您使用的Trinity软件的版本不一致导致的。建议您升级或降级Trinity软件版本以匹配bootstrap参数。

具体解决方法如下：

查看Trinity的版本：在终端中输入以下命令：

Trinity --version

修改bootstrap参数：在Trinity软件目录下的"trinity_plugins"文件夹中找到"Makefile"文件，使用文本编辑器打开。在文件中查找"TRINITY_HOME"，将其中的版本号修改为与您查看到的版本号一致。例如：

TRINITY_HOME = /usr/local/Cellar/trinityrnaseq/2.8.4

重新编译Trinity软件：在Trinity软件目录下，运行以下命令：

make

这些步骤完成后，您可以重新运行Trinity软件组装转录组样品，看看是否还会出现该报错