请问用R语言做WGCNA时出现报错：“不允许有重复的'row.names'”如何解决？

Question

以下是我输入的代码：

traitData =read.csv( "C:/Users/YY/Desktop/WGCNA/去除游离数据/SGTPP-CET-739749.csv")
dim(traitData)
names(traitData)
head(traitData)
# remove columns that hold information we do not need.
allTraits = traitData[, c(1:7)]
dim(allTraits)
names(allTraits)
# 形成一个类似于表达数据的数据框架，以保存临床特征。
SGT = rownames(datExpr)
traitRows = match(SGT, allTraits$Chicken)
datTraits = allTraits[traitRows,-1]
rownames(datTraits) = allTraits[traitRows, 1]

在最后这一步时，出现报错：“ Error in .rowNamesDF<-(x, value = value) : 不允许有重复的'row.names'
In addition: Warning message:
non-unique values when setting 'row.names': ”

我输入的文件是这样的：

sample    0h    4h    8h    12h    16h    20h
Pineal_retina_734    1    0    0    0    0    0
Pineal_retina_735    0    1    0    0    0    0
Pineal_retina_736    0    0    1    0    0    0
Pineal_retina_737    0    0    0    1    0    0
Pineal_retina_738    0    0    0    0    1    0
Pineal_retina_746    1    0    0    0    0    0
Pineal_retina_747    0    1    0    0    0    0
Pineal_retina_748    0    0    1    0    0    0
Pineal_retina_750    0    0    0    0    1    0
Pineal_retina_751    0    0    0    0    0    1
Pineal_retina_758    1    0    0    0    0    0
Pineal_retina_759    0    1    0    0    0    0
Pineal_retina_760    0    0    1    0    0    0
Pineal_retina_761    0    0    0    1    0    0
Pineal_retina_762    0    0    0    0    1    0
Pineal_retina_763    0    0    0    0    0    1

请问有没有出现相同情况的，我卡了好多天了也没解决。

Answer 1

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