liu9827885
godstudydayup
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2019-03-14 21:08

zlib.h明明已经安装了最新版本了,为什么还是报错

'/tmp/RtmpSb4SxA/R.INSTALL7b39072979/Rhtslib/src/htslib-1.7'/

Makefile.Rhtslib:128: warning: overriding recipe for target '.c.o'/

/home/daixuelei/anaconda2/lib/R/etc/Makeconf:160: warning: ignoring old recipe for target '.c.o'/

x86_64-conda_cos6-linux-gnu-cc -g -Wall -O2 -I. -c -o kfunc.o kfunc.c
x86_64-conda_cos6-linux-gnu-cc -g -Wall -O2 -I. -c -o knetfile.o knetfile.c
x86_64-conda_cos6-linux-gnu-cc -g -Wall -O2 -I. -c -o kstring.o kstring.c
x86_64-conda_cos6-linux-gnu-cc -g -Wall -O2 -I. -c -o bcf_sr_sort.o bcf_sr_sort.c
x86_64-conda_cos6-linux-gnu-cc -g -Wall -O2 -I. -c -o bgzf.o bgzf.c/

In file included from bgzf.c:39:0:/

htslib/bgzf.h:35:10: fatal error: zlib.h: No such file or directory
#include
^~~~~~~~
compilation terminated.
make[1]: *** [Makefile.Rhtslib:128: bgzf.o] Error 1
make[1]: Leaving directory '/tmp/RtmpSb4SxA/R.INSTALL7b39072979/Rhtslib/src/htslib-1.7'
make: *** [Makevars.common:23: htslib] Error 2
ERROR: compilation failed for package ‘Rhtslib’

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3条回答

  • aalbertini aalbertini 2年前

    文件不要到处乱拷贝。 修改Makefile, 添加 -I 来增加头文件搜索目录。

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  • benpaodaoren benpaodaoren 2年前

    可以先搜索下zlib.h在哪个目录下,然后再makefile文件里面添加这个路径,搜索zlib.h可以使用这个命令:
    find / -name zlib.h

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  • zaq15csdn greatofdream 2年前

    zlib.h 不在路径里,你看看报错。
    把这个文件放在你make命令执行的工作目录中。

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