代码进行基因注释，如何批量实现？

Question

TCGA基因注释信息能全部注释上吗？
1.gencode方式下载gtf文件进行注释，现在gencode网站点不开下载的链接，另外这种注释信息能注释上每个样本中的ensemble id吗？

2.看网上还有许多种注释信息，有什么区别呢？应该选哪一种注释呢？

3.我注释出来的基因数量减少了非常多，原本的基因数量是7万➕，注释出来后是6万➕，这是不是说有一万基因没有注释上，这些没有注释上的基因该怎样处理呢？

Answer 1

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