re.sub()对A文件中每个以>开头的字符串，在B文件查找并以该字符串在B所在列名替换A中的该字符串

Question

您好，我有100多个.faa文件（蛋白序列文件），想要对其中的>开头的字符串进行替换，需要替换成B表格文件（物种-序列对应表）中的列名。
我尝试用python中的re.sub()进行查找替换，但总是报错。
下面是我使用的代码：

import pandas as pd
import re
from Bio import SeqIO
matrixlist=pd.read_excel("/mnt/f/MAGs/meishan7/downstram/MGIItree/test/gene1.xlsx")
a=pd.DataFrame(matrixlist)
idlist=[]
seqlist=[]
dictpro={}
for seq in SeqIO.parse('/mnt/f/MAGs/meishan7/downstram/MGIItree/test/proteins.faa','fasta'):
    pid=seq.id
    seq=seq.seq

Answer 1

是不是类似这样操作，循环替换。

import re

s=['gene>ggcctt>tggc','gene>ctct']
s1=[]
for x in s:
    x1=re.sub('>',"",x)
    s1.append(x1)
print(s1)