mayavi使用mlab.contour3d绘制dicom三维图像速度很慢，如何使其能够实时加载显示绘制结果？

Question

在对原始的dicom数据做图像分割后，要进行三维重建，选择了使用mayavi，使用mlab.contour3d函数，发现mlab.show()后，要很长时间才能显示出绘制结果，整个等待过程中显示窗口一片空白，有没有什么方法能把这个绘制过程显示，即一边绘制一边就把绘制的内容显示出来，而不是全部绘制完了才显示，网上查了好久没找到类似的介绍和方法，

Answer 1

以下回答参考 皆我百晓生、券券喵儿 等免费微信小程序相关内容作答，并由本人整理回复。

Mayavi是一个非常强大的可视化工具，可以用来处理各种类型的科学数据。如果你想要实时地查看和更新一个3D渲染的结果，你可以尝试以下步骤：

1. 保存你的DICOM数据为HDF5格式，这样你就可以轻松地读取它并进行操作。

2. 使用Python中的hdf5py库来读取和写入HDF5文件。例如：

import h5py

# 打开HDF5文件
with h5py.File('my_dcm_file.h5', 'r') as f:
    # 获取dicom数据集
    data = f['/data']

    # 从dicom数据中提取感兴趣的数据（比如像素值）
    pixel_values = data[0]

    # 创建一个新的Mayavi场景
    scene = mlab.figure()

    # 使用mlab.contour3d来绘制这些像素值
    mlab.plot3d(pixel_values, [0, 1], [0, 1])

    # 设置颜色、透明度等参数
    mlab.colorbar()

1. 然后你可以使用scene.scene.mlab.show()来展示你的3D图。

2. 如果你想让Mayavi自动刷新图形，你可以使用scene.scene.mlab.render()或者scene.scene.mlab.update()。

3. 为了使绘图更流畅，你可以考虑将绘图设置为线程安全，并且只在一个线程上运行。

4. 最后，记得关闭你的HDF5文件以释放资源。

注意：这只是一个基本的示例，实际的操作可能需要根据你的具体需求进行调整。