如何利用Python转化Excel为fasta呢？是先要用Python将Excel转化为csv再转化为fasta吗？有朋友有代码解释吗？
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CSDN专家-HGJ 2022-04-11 15:16关注在github上有处理代码，可参考一下：
https://github.com/kuod/cctf/blob/master/parser.py本回答被题主选为最佳回答 , 对您是否有帮助呢?评论 打赏解决 1无用举报 编辑记录
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- 2022-04-19 08:29回答 1 已采纳 import re def run(): fasta_str = """WP_018731760.1 NAD(P)-binding domain-containing protein [Sal
- 2017-04-25 05:44回答 3 已采纳 try this ``` if __name__=="__main__": main(args) ```
- 2022-03-20 04:01回答 6 已采纳 # -*- utf8 -*- """ pyCode : test.py Created by: Taro Description: 2022/3/20 0020 """ import os impor
- 2022-07-08 12:29我是菜鸟www的博客 有时候我们可能需要将fasta格式的序列文件转换为表格形式，诸如方便对基因号进行排序的操作，以及方便获取全部的id
- 2021-05-29 00:51回答 2 已采纳 list index out of range 错误出现的原因主要有两个，一个可能是下标超出范围，一个可能是list是空的，没有一个元素 比如 a = random.randint(0,
- 2019-06-27 20:46回答 2 已采纳 ``` # -*- coding:utf-8 -*- import os from Bio import SeqIO # root_dir为要读取文件的根目录 root_dir =
- 2019-06-27 21:38回答 3 已采纳 from Bio import SeqIO for xx in range(1, 68): xn = "split__" + str(xx) + ".fasta" yn = "selec
- 2020-07-14 12:20xiaobai1_1的博客 从第二行开始为序列本身，只允许使用既定的核苷酸或氨基酸编码符号。序列部分可以在一行，也可以分成多行。 CSV文件是最通用的一种文件格式，它可以非常容易地被导入各种PC表格及数据库中。 此文件
- 2021-05-19 15:51回答 2 已采纳 参考一下：https://blog.csdn.net/david10251025/article/details/102093869
- 2019-07-03 21:26回答 2 已采纳 使用os.listdir('目录路径') 列表形式返回该目录下的所有文件名，然后你再依次读取和处理就ok了
- 2021-10-26 10:35回答 1 已采纳 是不是类似这样操作，循环替换。 import re s=['gene>ggcctt>tggc','gene>ctct'] s1=[] for x in s: x1=re.s
- 2023-12-07 16:34超凡脫俗的博客 创建 DataFrame 对象读取 Excel 文件写入 Excel 文件筛选数据排序数据计算数据合并数据删除数据通过学习本文，将能够使用 Python 进行excel和csv各种操作。
- 2024-08-27 18:31达芬奇文西的博客 此sheet需要是Excel文件的第一个sheet，Excel文件命名为“序列表.xlsx.”：现有一个存储序列（DNA序列或者蛋白序列）的Excel文件，将其中序列合并到一个fasta文件中。运行代码，将在D://1中生成“序列.fasta”文件，...
- 2022-03-18 17:33郑二狗的博客 当你有一个ID文件，该如何批量提取所对应的fasta序列？
- 2022-03-10 16:57程序员孔乙己的博客 Python 是人工智能（机器学习）的首选编程语言，它拥有众多模块，能完成人工智能开发的所有环节，没有任何一种语言使用起来如此顺手。今天就由我带着大家揭开人工智能的神秘面纱。 主页点击领取资料，等你一起来玩...
- 2023-01-07 15:00weixin_48409429的博客 已经在Linux系统的conda环境安装好如下软件（conda activate snakemake） 软件名称 软件功能 Trimmomatic 质控 megahit 组装 prodigal 基因预测 linclust 聚类 salmon 定量 diamond 注释 准备工作： 将raw read放到....
- 2019-04-09 20:32xszzgyyz55的博客 7.2将7.2.2的示例代码中出现的表转化为一个嵌套字典的列表 table = [ ['protein', 'ext1', 'ext2', 'ext3'], [0.16, 0.038, 0.044, 0.040], [0.33, 0.089, 0.095, 0.091], [0.66, 0.184, 0.191, 0.191], ...
- 2020-12-06 18:11weixin_39628498的博客 常用的处理软件包括：以微软Excel为代表的电子表格软件Notepad++/SublimeText等文本编辑器sed/awk/cut等Shell命令各种编程语言的数据处理库。然而，电子表格软件和文本编辑器固然强大，但依赖鼠标操作，不适合批量...
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