使用MEGA时，我用mega顺利的生成一个聚类树，并用newick格式保存这个树，也成功保存了。但是，再次使用mega打开这个newick文件时遇到了问题。并且使用figtree也打不开这个newick文件。
为什么使用MEGA时，我用mega顺利的生成一个聚类树，保存的newick文件无法打开
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- 2025-07-11 13:58蓝景科信的博客 此外，系统发育树使用了来自多个物种的同系物进行树木分析，结果（图1A）表明MsMYB35与MtMYB35、PsMYB35、TrMYB35和GmMYB35 密切相关，形成一个具有高bootstrap值的强进化枝 （100），表明具有相当大的进化相似性。...
- 2024-06-27 09:44程序猿鑫的博客 层次聚类是一种将数据点逐步分组形成层次结构的聚类方法，可以通过树状图（树状图表示法）来展示不同聚类级别的关系。WPGMA（加权平均法）和UPGMA（未加权平均法）是常见的层次聚类算法，它们基于距离或相似性度量来...
- 2017-07-10 10:54总结，MEGA4作为一款综合性的分子进化遗传学分析软件，为科研人员提供了全面的序列处理和进化分析功能。它的广泛应用表明了在生物信息学研究中，有效利用软件工具对于提高研究效率和质量的重要性。无论是在教学还是...
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- 2020-11-11 15:20科研小行星的博客 通过进化树，我们可以得到一些非常有价值的信息，比如说某几个物种在同一分支上，说明他们有着较近的亲缘关系，更有可能他们之间存在着祖先与进化的关系。比如最近来势汹汹的新冠肺炎，下图为从网上找的冠状病毒遗传...
- 2024-04-12 19:15梦仔生信进阶的博客 构建进化树有很多可选的算法，其中比较常用的NJ（邻接法），也有基于似然法NL，如下图所示，构建进化树具体方法可以参考我之前写的。特点： 1. 运算较NJ法很耗时，需要等一段时间，特别是样本数比较多时，可能需要3h...
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- 2022-10-30 17:14ACxz的博客 与单个对象场景 (传统上对nerf进行评估) 相反，我们的规模提出了多个挑战，包括 (1) 需要对具有不同照明条件的数千个图像进行建模，每个图像仅捕获场景的一小部分，(2) 令人望而却步的大模型容量，使其无法在单个GPU...
- 2022-09-14 16:38尤小恩Shmily&y的博客 很保姆级别的教程。 如何使用MEGA软件进行序列比对、计算遗传距离以及构建系统发育树？（收藏版） - 知乎
- 2023-07-24 22:12林林宋的博客 pooling=8，因为统计数据集的phn-dur平均值为9.1(phoneme pooling或者8倍pooling，个人认为8倍会好一点，比phoneme更鲁棒，因为脏数据提取的phoneme边界不太准确)，content length需要用对齐信息扩展到T，然后//8。...
- 2017-05-31 21:17可以用于分子标记作图
- 2025-05-26 21:01qq_27390023的博客 MEGA（Molecular Evolutionary Genetics Analysis） 是一款用于分析分子序列（DNA、RNA、蛋白质）的软件
- 2025-10-02 10:25yolo5detector的博客 本文综述了基因组内和跨基因组密码子使用的可视化研究进展，涵盖密码子稳定系数（CSCg）的计算方法、常用密码子指数（如RSCU、CAI、Nc等）的计算工具与数据库，以及密码子上下文对翻译起始、延伸和终止的影响。...
- 2023-01-12 10:38CAAS_IFR_zp的博客 OrthoFinder2做一个12个真菌的系统发育树
- 2021-05-01 10:20平凡的小何同学的博客 （1）使用教材 §7 航空公司客户价值聚类分析配套示例数据和代码，掌握其特征构造操作过程 （2）考虑：使用其它模型参数, 聚类算法, 并观察结果；利用数据探索分析结果, 提取有用的变量/特征, 进行聚类分析, 观察...
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- 2024-07-23 15:38生信宝典的博客 分枝长度 (Branch Length)：进化距离/遗传距离/SNP距离/遗传变异度，衡量进化枝变化的程度：越短代表序列差异越小(相似度越高)，进化距离也就越近(计算2个序列的遗传距离时，需追溯至它们的。外群 (Out-group)：与所...
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- 2021-05-14 22:08奶爸保-嘉林的博客 各位大神们，我是一个刚刚开始进行生物信息分析实验的本科生，我需要做一个宁夏枸杞ACS基因的电子克隆，但是貌似NCBI的数据库里没有我需要的EST序列，所以只能采用同科的番茄来进行电子克隆。但是刚刚开始就遇到了很...
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11月10日
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11月2日