关注
码龄
粉丝数
原力等级 --
被采纳
被点赞
采纳率
2201_75425732
2022-11-24 12:34
浏览 21
首页
编程语言
已结题
python怎么安装biom-format呀,显示错误,
python
我是用pip安装的,然后出现了下面这个错误,也安装了wheel,但还是不行,有谁能解答一下吗?
收起
写回答
好问题
0
提建议
关注问题
微信扫一扫
点击复制链接
分享
邀请回答
编辑
收藏
删除
收藏
举报
0
条回答
默认
最新
查看更多回答(-1条)
向“C知道”追问
报告相同问题?
提交
关注问题
生物观察矩阵(
BIOM
)格式项目_
Python
_Cython_下载.zip
2023-04-13 23:51
Python
是一种流行的
编程语言
,尤其在科学计算和数据分析领域。在处理
BIOM
格式时,
Python
库如`
biom
-
format
`提供了读取、写入和操作
BIOM
文件的功能。这个项目可能包含了用
Python
编写的代码示例,演示如何使用该库进行...
BIOM
:生物观测矩阵——微生物组数据通用数据格式
2018-12-01 21:10
刘永鑫Adam的博客
文章目录简介
biom
工具
安装
文件格式小提示和常见问题快速使用Quick Start文件格式转换
biom
文件添加样本分组和物种注释
BIOM
表统计Reference附录1.
Python
中交互操作
biom
的函数函数猜你喜欢写在后面 简介 ...
conda
安装
qiime2-清华镜像源替换法解决
安装
失败
2022-02-21 07:00
刘永鑫Adam的博客
conda
安装
qiime2(目前最有效的方法)作者:杨帅单位:徐州医科大学研究方向:动脉粥样硬化与肠道菌群联系方式:shuai_yang8@163.com一、环境linux-ubuntua...
r语言怎么把txt数据变成一个Rdata格式_
BIOM
:生物观测矩阵——微生物组数据通用数据格式...
2020-11-20 13:01
weixin_39551993的博客
简介http://
biom
-
format
.org/
BIOM
格式是微生物组领域最常用的结果保存格式,优点是可将OTU或Feature表、样本属性、物种信息等多个表保存于同一个文件中,且格式统一,体积更小巧,目前被微生物组领域几乎所有主流...
json txt格式转换器_
BIOM
:生物观测矩阵——微生物组数据通用数据格式
2020-11-20 13:01
weixin_39614874的博客
简介http://
biom
-
format
.org/
BIOM
格式是微生物组领域最常用的结果保存格式,优点是可将OTU或Feature表、样本属性、物种信息等多个表保存于同一个文件中,且格式统一,体积更小巧,目前被微生物组领域几乎所有主流...
PICRUSt2分析实战:16S扩增子OTU或ASV预测宏基因组、新增KEGG层级
2021-07-09 07:00
刘永鑫Adam的博客
尽管这些基因家族是有用的,但它们通常只占宏基因组内总遗传变异的一小部分,而且可能会被
错误
注释。 PICRUSt2到高级功能(例如路径)的映射完全取决于所使用的映射文件。因此,在通路注释或基因功能分配中的任何...
PICRUSt2分析实战:16S扩增子OTU或ASV预测宏基因组EC、通路、KO(200806更新)
2020-08-10 07:00
刘永鑫Adam的博客
尽管这些基因家族是有用的,但它们通常只占宏基因组内总遗传变异的一小部分,而且可能会被
错误
注释。 PICRUSt2到高级功能(例如路径)的映射完全取决于所使用的映射文件。因此,在通路注释或基因功能分配中的任何...
QIIME 2教程. 11元数据Metadata(2021.2)
2021-03-29 00:49
刘永鑫Adam的博客
但是,建议使用keemi验证元数据,因为每次运行keemi时都会
显示
所有验证
错误
和警告信息的报告。在QIIME 2中加载元数据通常一次只会出现一个
错误
,特别是在元数据有很多问题的情况下,这会使识别和解决验证问题变得很...
QIIME 2教程. 31名词Glossary(2021.2)
2021-04-18 00:33
刘永鑫Adam的博客
Artifact可以作为action的输入文件,用QIIME 2 Artifact API的工具加载后供
Python
3使用,或者用qiime2R加载供R使用。Artifact也可以作为QIIME 2的输出文件供其他软件使用。 数据来源/出处(data provenance) 详见...
MPB:使用QIIME 2分析微生物组16S rRNA基因扩增子测序数据(视频)
2021-03-17 00:47
刘永鑫Adam的博客
为进一步提高《微生物组实验手册》稿件质量,本项目新增大众评审环节。文章在通过同行评审后,采用公众号推送方式分享全文,任何人均可在线提交修改意见。公众号格式
显示
略有问题,建议电脑端点击文末阅...
【亲测免费】 scikit-bio 项目常见问题解决方案
2024-11-06 10:10
宫文琼Perfect的博客
该项目的主要
编程语言
是
Python
。 ## 新手使用注意事项及解决方案 ### 1. 环境配置问题 **问题描述**:新手在
安装
和配置 scikit-bio 时,可能会遇到依赖库版本不兼容或环境配置
错误
的问题。 **解决步骤*...
Qiime2配置文件详解与多版本对比
2025-09-13 23:38
一一MIO一一的博客
-
biom
-
format
未被 conda 收录,使用 pip
安装
。 3.4.2 测试与验证配置效果 构建环境并进行功能测试: # 创建并激活环境 conda env create -f qiime2.yml conda activate micro
biom
e-analysis # 启动 Jupyter ...
BIOM
格式文件_微生物组数据通用数据格式
2022-04-13 10:07
环微分析的博客
生物观测矩阵(Biological Observation Matrix,
BIOM
)是微生物组数据通用数据格式(The Biological Observation Matrix (
BIOM
)
format
—
biom
-
format
.org),
BIOM
格式的表称为
biom
表,一般使用.
biom
扩展名。
biom
表...
如何用FAPROTAX预测微生物群落功能
2018-12-28 07:20
刘永鑫Adam的博客
前言 本文转载自微生物生态公众号,己获授权。... FAPROTAX脚本及数据库下载: FAPROTAX是由
python
语言编写的脚本collapse_table.py 当前最新版本依然是FAPROTAX 1.1,2017年6月10日更新,
安装
方法如下: wget ...
QIIME 2教程. 20实用程序Utilities(2020.11)
2019-10-31 09:18
刘永鑫Adam的博客
文章目录前情提要命令行界面`q2cli`基本用法 Basic usage开启命令行补全Enable command-line tab completionBashZsh验证标签页完成 Verify tab completionReference译者简介猜...1简介和
安装
Introduction&Inst...
多元相关性分析_NAR:宏基因组网络分析工具MetagenoNets
2020-11-21 06:07
weixin_39801165的博客
在当前的最新状态下,对微生物相关网络的典型研究要求依赖于独立的通用软件、插件、本地
安装
的程序以及高级编程知识。数量有限的可用Web应用程序要么太专门于其他研究领域,要么提供的功能很少。此外,当前缺乏允许...
QIIME 2教程. 31名词Glossary(2020.11)
2020-05-25 20:18
刘永鑫Adam的博客
1简介和
安装
Introduction&Install 2插件工作流程概述Workflow 3老司机上路指南Experienced 4人体各部位微生物组分析Moving Pictures Genome Biology:人体各部位微生物组时间序列分析 5粪菌移植分析练习FMT ...
HUMAnN2:人类微生物组统一代谢网络分析2
2018-05-17 13:00
刘永鑫Adam的博客
如果你
安装
过
python
,且有pip
安装
工具,可以轻松
安装
humann2 # 软件
安装
pip install humann2 # 或可选手动下载
安装
wget //files.
python
hosted.org/packages/43/07/ec41577c3c1f9b578875ade8ed549d14fc2944c13...
NAR:宏基因组网络分析工具MetagenoNets
2020-06-21 07:00
刘永鑫Adam的博客
在当前的最新状态下,对微生物相关网络的典型研究要求依赖于独立的通用软件、插件、本地
安装
的程序以及高级编程知识。数量有限的可用Web应用程序要么太专门于其他研究领域,要么提供的功能很少。此外,当前缺乏允许...
QIIME 2用户文档. 11元数据Metadata(2019.7)
2019-10-24 00:00
刘永鑫Adam的博客
前情提要NBT:QIIME 2可重复、交互和扩展的微生物组数据分析平台1简介和
安装
Introduction&Install2插件工作流程概述Workflow3老司机上路指南Exp...
没有解决我的问题,
去提问
向专家提问
向AI提问
付费问答(悬赏)服务下线公告
◇ 用户帮助中心
◇ 新手如何提问
◇ 奖惩公告
问题事件
关注
码龄
粉丝数
原力等级 --
被采纳
被点赞
采纳率
系统已结题
12月2日
关注
码龄
粉丝数
原力等级 --
被采纳
被点赞
采纳率
创建了问题
11月24日