关于#python#的问题：一条序列中的元素与另一条序列中的元素一一对应的比较方法

Question

刚刚学python，想写一个关于文本内容比对的代码，这是从文本中摘取的几列内容
#Sequence Barcode Count Percentage(%)
AAGAGTGTATGTAGGGAGGA barcodeMD-AS-17MD-S-50 73974821 1.240810
GGTGGAAGGGGGAGGTGGTG barcodeMD-AS-21MD-S-61 73670799 1.235710
GGTGGAAGGGCTAGGGAGCA barcodeMD-AS-21MD-S-50 73627661 1.234987
GGAGTTATGGCTGAGTGGTT ambiguous 22315579 0.374308
我需要比对的ambiguous这一行的Sequence和其他列的Sequence中不同的碱基，如果超过3个碱基不同，就将他舍弃，如果是三个碱基以下则将其写入文本文件中，并输出一共有多少有个碱基差异小于3个序列。
现在代码写完了，但是我嵌套了三个循环导致代码运行速度很慢，有办法可以提高他跑的速度呢？
目前我采用的方法是，一条序列中的元素与另一条序列中的元素，一一对应进行比较，还有别的方法可以达到这样的效果吗？

allcount = 0 #定义一个计数器 
for w in range(0,listAmbiguousLen): #我将所有的ambiguous列添加到了一个列表中，listAmbiguousLen 指的是ambiguous一共有多少行
    for u in range(0,lenSeq): #Seq是整个文本，lenSeq指的是这个文本一共有多少行
        count = 0  # 定义一个计数器
        uncount = 0 
        for x in range(0,lenAmbiguous): # lenAmbiguous 指的是Sequence列中，碱基的个数，一般为20个
            if listAmbiguous[w][x] == Seq[u][x]: #如果first的元素与list的元素相同
                count = count + 1  
            else: # 如果不相同
                uncount = uncount+1  
            if uncount>3: # 如果碱基不同的个数大于3个，则舍弃
                break
            elif count > lenAmbiguous-number: #如果碱基小于三个，就把他写入文档中
                allcount = allcount + 1 #allcount+1
                l.write(str(uncount)+"\t"+listAmbiguous[w]+"\t\t"+Seq[u])
                break

Answer 1

import Levenshtein

a = 'GGAGTTATGGCTGAGTGGTT'
b = 'GGTGGAAGGGCTAGGGAGCA'

res = Levenshtein.hamming(a, b)
print(res)
--result
10