gromacs计算过程出错

Question

在用gromacs进行动力学计算的nvt预平衡过程时出现图片中的错误，需要怎么解决？

Answer 1

这个错误消息来自Gromacs分子动力学模拟软件，表示在模拟过程中有一个或多个水分子无法被解决。建议检查不良接触并/或在适当时减小时间步长。程序已经将先前和当前坐标写入pdb文件中。