lammps-in文件

Question

在lammps书写in文件的过程中，有哪个命令可以表达粒子穿过十次模拟盒子，还是说并没有？需要通过其他方法去表达出来。

Answer 1

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LAMMPS中并没有直接的命令可以表达粒子穿过模拟盒子的次数。不过可以通过其他方式来实现这个功能，例如使用自定义的fix来记录每个粒子穿过模拟盒子的次数。下面是一种实现方式：

• 定义一个新的fix，例如"fix pass_box_count all ave/time 1 10 10 c_pass_box"

fix pass_box_count all ave/time 1 10 10 c_pass_box

• 定义一个新的compute，用于计算每个粒子穿过模拟盒子的次数。这里假设模拟盒子的边界是xlo、xhi、ylo、yhi、zlo、zhi。

compute pass_box all property/atom x y z
variable pass_box equal 0
label loop
variable i atom
variable x atom
variable y atom
variable z atom
if {${x} < xlo} then "variable pass_box add 1" 
if {${x} > xhi} then "variable pass_box add 1"
if {${y} < ylo} then "variable pass_box add 1"
if {${y} > yhi} then "variable pass_box add 1"
if {${z} < zlo} then "variable pass_box add 1"
if {${z} > zhi} then "variable pass_box add 1"
next i
jump SELF loop

• 使用fix ave/time命令来计算每个时间步长内通过模拟盒子的粒子数量的平均值，并将其保存到c_pass_box中。

fix pass_box_count all ave/time 1 10 10 c_pass_box

这样，c_pass_box中保存的就是每个时间步长内通过模拟盒子的粒子数量的平均值，也就是通过模拟盒子的次数。通过这个方式，可以监控每个粒子通过模拟盒子的次数，并根据需要进行相关的处理。