2301_76243777 2023-02-21 17:52 采纳率: 35.7%
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为什么我下载的fastqc没有那个.html的结尾的文件呢

为什么我下载的fastqc没有那个.html的结尾的文件呢
而且,还没法使用fastqc SRR3589958.sra_1.fastq.gz 命令 ,一直让我安装fastqc,这是什么原因呢

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  • simleeyes 2023-02-22 14:27
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    首先,确保已经从 FastQC 的官方网站下载了正确的版本(_FastQC 的官方网站下载地址是:https://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/fastqc/%E3%80%82%E4%BD%A0%E5%8F%AF%E4%BB%A5%E5%9C%A8%E8%BF%99%E4%B8%AA%E7%BD%91%E7%AB%99%E7%9A%84%E9%A1%B5%E9%9D%A2%E4%B8%AD%E6%89%BE%E5%88%B0%E6%9C%80%E6%96%B0%E7%89%88%E6%9C%AC%E7%9A%84 FastQC 软件和文档,包括安装指南和用户指南等。在下载页面中,你可以根据你的操作系统和处理器架构选择相应的版本进行下载。_),然后将其解压缩到你想要安装的目录中。解压缩后,你应该可以在该目录中看到一个名为 fastqc 的可执行文件。如果你在命令行运行 fastqc,它应该输出一些帮助信息,表示安装成功。
    如果你运行 fastqc SRR3589958.sra_1.fastq.gz 命令时遇到问题,可能是因为你没有将 FastQC 添加到 PATH 环境变量中。你需要将 FastQC 安装目录的路径添加到 PATH 环境变量中,这样系统就能够找到它。具体来说,你需要将以下内容添加到你的 shell 配置文件中(例如 ~/.bashrc 或 ~/.zshrc):

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    其中,/path/to/fastqc 应该替换为你实际的 FastQC 安装路径。

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