小太阳Pro 2023-02-26 02:38 采纳率: 66.7%
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构建载体遇到了问题,有特异性片段,测序无信号或者连接的是T载

请问一下大家,有没有人碰到这种情况:
构建表达载体时,用的同源重组法,扩出了目的条带,单酶切了载体,也长了单菌落,PCR验证了。但是送测序得到的结果是目的+T载。我不知道是哪里出了问题。是没扩出同源臂吗?还是载体酶切没切开?我重做了两次扩增和酶切结果都一样。所以迷茫了

后来听别人说建议我菌液PCR用载体引物F+目的片段引物R验证,出现条带单一明亮且正确,但是用载体的引物测单向却失败无信号。 测通结果依旧是目的片段+T载体 ,请问大家是哪里出了问题呀?

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  • MarkHan_ 2023-02-26 02:53
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    该回答引用GPTᴼᴾᴱᴺᴬᴵ
    这种情况可能出现在同源重组法构建表达载体时,载体与目的片段连接的特异性不高或存在其他问题,导致测序结果中出现T载体或者目的片段+T载体的情况。

    其中可能的问题有:

    1. 同源重组法效率低,没有扩增出同源臂或同源臂长度不够,导致连接的特异性较低;
    2. 载体酶切没有切开或者酶切效率不高,导致连接的特异性较低;
    3. 测序结果存在污染或误判,导致结果不准确。

    针对这种情况,可以尝试以下措施:

    1. 重新设计同源重组法扩增引物,确保同源臂长度足够,提高连接的特异性;
    2. 重新酶切载体,确保酶切完全,提高连接的特异性;
    3. 对扩增产物进行纯化和测序验证,确认扩增产物的正确性;
    4. 选择其他测序方法或测序公司,比如Sanger测序等,以便更好地验证扩增产物的正确性。

    总之,针对这种情况,需要从多个方面排查问题,确认扩增产物的正确性,以便得到准确的结果。

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    小太阳Pro 2023-02-26 03:04

    好的!谢谢大佬!!

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