Wllde 2023-05-24 18:11 采纳率: 0%
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分子动力学模拟跨膜namd能量最小化

有没有高水帮助一下,想问一下,NAMD跑分子动力学模拟时,分子跨膜,在能量最小化阶段,会出现膜分裂是为什么呢?能量最小化完成后,膜又会合成整体。

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  • TechLead KrisChang 人工智能领域优质创作者 2023-05-25 11:33
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    膜的初始构象过于紧密或过于松散,可能会导致分裂。
    再检查检查力场选择(立场不合适)以及模拟参数(速度过快、步长过大等)设置。

    这些原因都有可能,一个个排查一下。


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