Structure做群体结构分析
用hmp数据做Structure的时候,要用数字1234代替AGCT,缺失为-9,我的hmp数据中有Y和R,请问用什么代替呢?
![](https://profile-avatar.csdnimg.cn/5cec1245a4104d4b9c78ad9cef4c922c_weixin_68277212.jpg!4)
Structure做群体结构分析
- 写回答
- 好问题 0 提建议
- 追加酬金
- 关注问题
- 邀请回答
-
2条回答 默认 最新
- 憧憬blog 2023-06-09 17:23关注
在Structure软件中,通常使用数字代替AGCT碱基,缺失值为-9。对于Y和R碱基,可以使用以下方式进行替换:
- Y碱基可以表示C/T的混合,可以将其用数字5来代替。
- R碱基可以表示A/G的混合,可以将其用数字6来代替。
因此,在使用Structure分析hmp数据时,您可以将Y碱基替换为数字5,将R碱基替换为数字6,并将其它碱基(A、C、G、T)替换为1、2、3、4四个数字中的一个。请注意,在替换后,您需要将数据保存为Structure软件支持的输入格式,例如PED格式或PLINK格式,然后在Structure软件中进行进一步的分析。
解决 无用评论 打赏 举报
悬赏问题
- ¥20 c语言写的8051单片机存储器mt29的模块程序
- ¥60 求直线方程 使平面上n个点在直线同侧并且距离总和最小
- ¥50 java算法,给定试题的难度数量(简单,普通,困难),和试题类型数量(单选,多选,判断),以及题库中各种类型的题有多少道,求能否随机抽题。
- ¥50 rk3588板端推理
- ¥250 opencv怎么去掉 数字0中间的斜杠。
- ¥15 这种情况的伯德图和奈奎斯特曲线怎么分析?
- ¥250 paddleocr带斜线的0很容易识别成9
- ¥15 电子档案元素采集(tiff及PDF扫描图片)
- ¥15 flink-sql-connector-rabbitmq使用
- ¥15 zynq7015,PCIE读写延时偏大