真心提问,请勿chatgpt直接糊弄,谢谢!
我找到原因了:
是因为我在npt聚合物的过程中用的是周期性边界,而我加入水或者我试着加了真空层,就出现了键拉长的现象。
我之前想过用wall/reflect压缩聚合物,但是我从MS导出并转入到lammps的模型使用的pair_style是 lj/cut/coul/long,他需要设置kspace,而kspace是在非周期性下使用的,我使用了kspace_modify slab 3.0,但是压缩过程中有些原子从聚合物链上脱落。还会报angle missing的错误
谁能帮帮我,好像进入死循环了
以下是原内容:
研究内容:水在聚乙烯表面的润湿
我用MS建模了聚乙烯链,然后导入到lammps种,把力场改成了oplsaa力场
并且对链进行了npt计算。得到了一定密度的聚乙烯。
此时的模型还没有问题。如下
然后我把水和它结合,就出现了bond伸长的现象。改变边界条件没有用。如下
而如果我用上下两个壁面,又会出现更离谱的键,如下
请问这怎么解决呢?
还有就是在npt聚合物过程中,聚合物链断了,是正常的吗,会不会有什么影响