tbss报错,perpoc后两个文件夹为空,想问一下问什么,代码如下

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问题描述:
在运行tbss的preproc步骤时,报错imglob: not found,并且生成的两个文件夹是空的。
问题分析:
imglob命令未找到,这可能是由于FSL软件包未正确安装或配置不正确导致的。解决方案:
tbss_1_preproc脚本是否可用并具有执行权限。tbss_1_preproc命令时是否遵循正确的语法格式。以下是一个示例代码,用于运行tbss_1_preproc脚本进行TBSS预处理:
import os
# 定义FSL的安装路径
fsl_path = "/usr/local/fsl"
# 添加FSL的执行路径到系统的环境变量
os.environ["PATH"] += os.pathsep + fsl_path + "/bin"
# 设置输入图像文件路径
input_files = "/mnt/hgfs/Data/DTI/*.nii.gz"
# 创建输出文件夹
output_folder = "/mnt/hgfs/Data/DTI/TBSSS"
if not os.path.exists(output_folder):
os.makedirs(output_folder)
# 运行tbss_1_preproc命令
command = f"{fsl_path}/bin/tbss_1_preproc {input_files}"
os.system(command)
请根据实际情况修改示例代码中的路径和文件名,并确保FSL软件包路径、输入图像文件路径和输出文件夹路径等设置正确。
如果问题仍然存在,请提供更多的错误信息以及相关代码和配置文件,以便更加具体地定位和解决问题。