tbss第一步，imglob文件出错

Question

*TBSS报错，perpoc后出现空文件夹

fsl安装后DTI预处理均顺利进行，
TBSS第一步出现问题，最开始的问题是提示imglob not found

分别尝试添加了三个imglob文件，结果均出现 imglob Permission denied（如图）

其中一个imglob链接https://open.win.ox.ac.uk/pages/fsl/fslpy/_modules/fsl/scripts/imglob.html

Answer 1

该回答引用自GPT-4,由博主GIS_Liu编写：

您好！根据您提供的信息和截图，您在运行Tract-Based Spatial Statistics（TBSS）的第一步时遇到了imglob权限被拒绝的错误。imglob是FSL软件包中的一个脚本，用于匹配特定模式的图像文件。报错Permission denied通常表示当前用户没有执行该脚本的权限。

为了解决您的问题，我们可以按照以下步骤操作：

1. 检查文件权限：

   • 使用ls -l命令查看imglob的权限设置。
   • 如果权限不足，可以用chmod命令来增加执行权限。例如：chmod +x /path/to/imglob。

2. 确认执行路径：

   • 确保您使用的是正确安装的FSL版本的imglob。
   • 通过命令which imglob确认其路径。

3. 环境变量：

   • 确保FSLDIR环境变量正确设置，且$FSLDIR/bin被加入到了PATH环境变量中。
   • 您可以在终端中运行echo $FSLDIR和echo $PATH来检查这些环境变量。

4. 使用正确的用户身份：

   • 如果您是通过sudo或以root身份安装的FSL，可能需要以同样的身份运行TBSS。

5. 检查文件路径和通配符：

   • 确保在运行TBSS脚本时提供的图像文件路径和通配符是正确的。错误的路径或通配符可能导致imglob无法找到任何文件，进而报错。

6. 查看错误日志：

   • 通常，FSL会在$FSLDIR目录下生成日志文件，您可以查看这些日志来获取更多错误信息。

7. 重新安装或更新FSL：

   • 如果以上步骤都无法解决问题，考虑重新安装或更新FSL到最新版本。

请尝试上述步骤，如果问题仍未解决，您可能需要查看FSL的官方文档或联系FSL的用户支持以获得更详细的帮助。如果您需要进一步的帮助来运行特定的命令或脚本，请告诉我，我可以为您提供代码示例。

希望这些信息能够帮助您解决问题！如果您有更多信息或需要进一步协助，请随时告知。

如果该回答解决了您的问题，请采纳！如果没有，请详述问题所在！