conda卡在Solving environment: / 该怎么办

Question

在下载samtools后liunx输入samtools
跳出samtools: error while loading shared libraries: libcrypto.so.1.0.0: cannot open shared object file: No such file or directory
后来查询得到可能是conda安装的这个版本太老，
之后根据他人的教程，输入命令：
conda install -c bioconda samtools openssl=1.0
但是卡在了Solving environment: / 一直不动，
有人建议删除samtools再重新安装，
conda remove samtools=1.7.0
Collecting package metadata (repodata.json): \ WARNING conda.models.version:get_matcher(538): Using .* with relational operator is superfluous and deprecated and will be removed in a future version of conda. Your spec was 1.6.0., but conda is ignoring the . and treating it as 1.6.0
WARNING conda.models.version:get_matcher(538): Using .* with relational operator is superfluous and deprecated and will be removed in a future version of conda. Your spec was 1.9.0., but conda is ignoring the . and treating it as 1.9.0
WARNING conda.models.version:get_matcher(538): Using .* with relational operator is superfluous and deprecated and will be removed in a future version of conda. Your spec was 1.7.1., but conda is ignoring the . and treating it as 1.7.1
WARNING conda.models.version:get_matcher(538): Using .* with relational operator is superfluous and deprecated and will be removed in a future version of conda. Your spec was 1.8.0., but conda is ignoring the . and treating it as 1.8.0
但是又再次卡到了Solving environment: /
安装源已经全部恢复成了默认格式

Answer 1

参考AI和波塞冬解析，希望能帮助到您
您遇到的问题主要涉及两个方面：

动态链接库缺失：samtools 报告 libcrypto.so.1.0.0 找不到。这通常意味着您的系统上缺少某个库或者该库的版本不正确。
Conda 安装问题：尝试使用 conda 安装或删除软件时，您遇到了 Solving environment 卡住的问题。这可能是由于 Conda 的环境问题，比如包冲突、源问题或其他网络/资源问题。
针对这两个问题，您可以尝试以下步骤：
1. 解决动态链接库问题
查找缺失的库：您可以使用 find 命令来查找 libcrypto.so.1.0.0 是否存在于您的系统上。

find / -name libcrypto.so.1.0.0 2>/dev/null

创建符号链接：如果找到了该库，但在不同的位置，您可以创建一个符号链接到预期的位置。

sudo ln -s /path/to/found/libcrypto.so.1.0.0 /path/to/expected/location/libcrypto.so.1.0.0

安装缺失的库：如果库确实缺失，您可能需要安装包含该库的包。在某些 Linux 发行版中，这可以通过包管理器来完成，如 apt、yum 或 dnf。
2. 解决 Conda 问题
更新 Conda：确保您的 Conda 是最新版本。

conda update conda

更换 Conda 通道：有时候，默认的 Conda 通道可能会遇到问题。您可以尝试切换到其他通道，如 conda-forge。

conda config --add channels conda-forge  
conda config --set channel_priority strict

清除缓存：清除 Conda 的缓存可能有助于解决问题。

conda clean --all

尝试不同的安装命令：尝试不使用版本号来安装 samtools 和 openssl。

conda install -c bioconda samtools openssl

手动下载和安装：如果上述方法都不起作用，您可以从官方网站或可信的源手动下载所需的 .tar.bz2 文件，并使用 conda 的 install 命令从本地文件安装。
希望这些建议能帮助您解决问题。如果问题仍然存在，请提供更多的错误信息或日志，以便更准确地诊断问题。