python调用xgboost时报错

Question

python调用xgboost时报错。

import xgboost

报错内容：

Traceback (most recent call last):
  File "<stdin>", line 1, in <module>
  File "/home/bio/.local/lib/python3.7/site-packages/xgboost/__init__.py", line 6, in <module>
    from .core import (
  File "/home/bio/.local/lib/python3.7/site-packages/xgboost/core.py", line 231, in <module>
    _LIB = _load_lib()
  File "/home/bio/.local/lib/python3.7/site-packages/xgboost/core.py", line 218, in _load_lib
    "Mismatched version between the Python package and the native shared "
  File "/opt/MLAGO/lib/python3.7/ctypes/__init__.py", line 377, in __getattr__
    func = self.__getitem__(name)
  File "/opt/MLAGO/lib/python3.7/ctypes/__init__.py", line 382, in __getitem__
    func = self._FuncPtr((name_or_ordinal, self))
AttributeError: /opt/MLAGO/lib/libxgboost.so: undefined symbol: path

尝试过别人提出的解决办法，如：

conda clean -i 
# 上面命令运行完成后看是否已经无报错，如果还有报错继续下面操作
cp ~/.condarc ~/.condarc_bak
rm ~/.condarc

我的问题没有得到解决。还有其他的解决方法嘛？

Answer 1

引自免费微信小程序：皆我百晓生

该错误信息指出在加载libxgboost.so时遇到了一个未定义的符号（undefined symbol: path），这表明可能存在以下问题：

1. 版本不匹配： 你可能安装了与Python环境中的xgboost Python包不兼容的xgboost C++库。请确保你的xgboost库和对应的Python绑定版本是配套的。尝试卸载现有的xgboost并重新安装正确版本，可以使用以下命令：

   pip uninstall xgboost
   pip install xgboost --upgrade # 或指定特定版本如：pip install xgboost==1.4.2
   

2. 依赖库缺失或损坏： 检查系统中是否有必要的依赖库，并确保它们是完整且正确的。对于Linux系统，可能需要安装一些开发工具和依赖库来编译xgboost。

3. 环境变量问题： 确保环境变量指向正确的库文件。如果xgboost是在非默认路径下安装的，或者有多个版本冲突，可能需要设置LD_LIBRARY_PATH环境变量以包含正确的libxgboost.so路径。

4. 清理并重建环境： 如果上述方法无效，考虑到你已经尝试过清理conda缓存，那么也可以尝试创建一个新的虚拟环境，并在新环境中单独安装xgboost:

   conda create -n new_env python=3.7
   conda activate new_env
   conda install xgboost
   

5. 手动编译安装： 在某些情况下，可能需要从源码编译xgboost来确保所有依赖正确链接。首先从GitHub获取最新稳定版源码，然后进行编译和安装：

   git clone --recursive https://github.com/dmlc/xgboost.git
   cd xgboost
   cp make/config.mk ./config.mk # 可根据需要编辑配置文件
   make -j4
   pip install -e . # 安装为editable模式，以便更新代码时自动生效
   

请注意，每一步操作前都应谨慎对待，特别是涉及全局环境变更的操作。在解决这类问题时，务必根据实际环境和需求进行调整。同时，查阅xgboost官方文档和相关社区论坛（如Stack Overflow）以获取更多针对性的帮助。