求MIMIC-CXR Dataset数据

Question

求MIMIC-CXR Dataset数据！
本人做实验的时候想要用一下这个数据，但是在给出的官网里发现并不是很好下载，有没有已经下载好的朋友能够共享一下？
这是官方给出的网址：https://physionet.org/content/mimic-cxr-jpg/2.0.0/

Answer 1

引自免费微信小程序：皆我百晓生

获取MIMIC-CXR Dataset数据可能需要一些额外步骤，因为官方网站上可能没有提供预下载的选项。不过，你可以在GitHub上找到一些社区贡献的资源，或者通过数据集管理工具来简化下载过程。以下是一个详细的步骤指南：

1. 安装必要的库: 首先，确保你已经安装了pip包管理器。如果没有，可以通过命令行运行 python -m pip install --upgrade pip。

2. 访问GitHub仓库: 有许多项目会提供预处理的MIMIC-CXR数据。一个常见的选择是浏览 MIMIC-CXR GitHub存储库。在搜索框中输入 "MIMIC-CXR dataset"，你会找到相关的数据集下载和处理脚本。

3. 找到合适的数据集: 在找到的项目中，比如mimic-cxr-dataset 或 pytorch-mimic-cxr 这样的项目，通常会有data 或 datasets 文件夹，里面包含下载链接或预处理后的数据。查看README文件或文档，了解如何获取数据。

4. 下载数据: 根据项目的指示，可能需要你下载原始图像数据（.tar.gz 或 .zip 文件）以及相应的标签文件。这些文件可能会很大，所以可能需要一些时间。

5. 解压数据: 使用命令行工具（如tar 或 unzip），根据文件扩展名解压下载的数据。例如，如果你下载的是.tar.gz文件，可以这样解压：

   tar -xvf mimic-cxr-jpg.tar.gz
   

6. 数据预处理: 如果数据还没有被预处理成适合实验的格式，可能需要运行项目提供的脚本来转换数据。这可能包括将图像转换为numpy数组、标签编码等操作。

7. 存储数据: 将数据移动到你的工作目录，或者按照项目要求的路径结构进行组织，以便在Python代码中方便地引用。

8. 加载数据: 在Python中，你可以使用像pandas和numpy这样的库来读取数据。例如，如果你的标签文件是CSV格式，可以这样做：

   import pandas as pd
   labels_df = pd.read_csv('labels.csv')
   images = np.load('images.npy')
   

请确保在使用任何第三方数据集时检查版权和许可条款，以确保你的使用符合规定。如果你在下载或处理过程中遇到问题，记得查阅项目文档或寻求社区支持。