OpenAlex数据下载以及导入mysql和orcle数据库

Question

OpenAlex数据下载以及导入mysql和oracle数据库

Answer 1

引自免费微信小程序：皆我百晓生

要将OpenAlex数据下载并导入到MySQL和Oracle数据库中，你需要按照以下几个步骤操作。首先确保你已经安装了必要的软件，比如Python（用于处理数据和与数据库交互），MySQL客户端或服务器（取决于你的需求），以及Oracle客户端或服务器。

1. 下载OpenAlex数据

OpenAlex数据可以通过他们的API获取，但这里我们先从其官方提供的CSV文件开始。这些文件可以在GitHub上找到：https://github.com/allenai/openalex/tree/master/data/exports

你可能需要下载多个CSV文件，包括papers.csv, venues.csv, authors.csv, fields_of_study.csv等，具体取决于你的需求。然后解压缩这些文件到本地目录。

2. 导入MySQL

对于MySQL，可以使用Python的pandas库读取CSV文件，并通过to_sql函数将其写入数据库。确保你已经安装了mysql-connector-python库（如果还没有，可以使用pip install mysql-connector-python进行安装）。

这是一个示例脚本，用于将papers.csv导入到MySQL：

import pandas as pd
from sqlalchemy import create_engine

# 创建数据库连接
engine = create_engine('mysql+pymysql://{username}:{password}@{host}/{database}?charset=utf8mb4'.format(
    username='your_username',
    password='your_password',
    host='localhost',  # 或者你的远程MySQL服务器地址
    database='openalex'
))

# 读取papers.csv文件
papers_df = pd.read_csv('papers.csv')

# 将DataFrame写入MySQL
papers_df.to_sql('papers', engine, if_exists='replace', index=False)

重复这个过程，为其他表格创建适当的SQL表并导入数据。

3. 导入Oracle

对于Oracle，你可以使用类似的步骤，但是需要安装cx_Oracle库（如果还没安装，可以使用pip install cx_Oracle）。以下是导入papers.csv到Oracle的示例：

import pandas as pd
import cx_Oracle

# 创建数据库连接
dsn_tns = cx_Oracle.makedsn('hostname', 'port', service_name='service_name')
connection = cx_Oracle.connect(user='your_username', password='your_password', dsn=dsn_tns)

cursor = connection.cursor()

# 创建papers表
create_table_query = '''
CREATE TABLE papers (
    id NUMBER PRIMARY KEY,
    title VARCHAR2(500),
    year NUMBER,
    venue_id NUMBER,
    -- 其他字段...
)
'''
cursor.execute(create_table_query)

# 将DataFrame写入Oracle
papers_df = pd.read_csv('papers.csv')
papers_df.to_sql(name='papers', con=connection, if_exists='replace', index=False)

# 关闭游标和连接
cursor.close()
connection.close()

同样地，为其他表格创建适当的SQL表并导入数据。

注意：在执行上述代码之前，你需要根据实际情况替换数据库用户名、密码、主机名、端口和服务名。此外，确保你的数据库用户具有足够的权限来创建表和插入数据。

如果你遇到任何错误或问题，检查你的数据库设置、网络连接和权限是否正确。