DS软件批量转换格式

Question

有100个小分子肽，通过Discovery studio已批量转换生成ds文档（.dsv格式），并全部放在桌面dsv文件夹（C:\Users\Lenove\Desktop\dsv），想通过Pipeline pilot软件批量转换成PDB格式文档，并存放在桌面pdb文件夹中（C:\Users\Lenove\Desktop\pdb）

DS，PP版本：2019版

目前已经自建了一个批量转格式的protocol，具体过程如下：
DS_Protein_Structure_Reader----------CHARMm Minimization----------PDB_Writer

各个Components的参数如下：

Component_1：DS Protein Structure Reader
参数：Source：C:\Users\Lenovo\Desktop\dsv\*.dsv
           Maximum：空
           SourceTag：Filename
           Remove Alternate Conformers：True

Component_2：默认

Component_3：PDB Writer
参数：Destination：'C:'.'\'.'Users'.'\'.'Lenove'.'\'.'Desktop'.'\'.'pdb'.'\'.SourceTag.'.pdb'
           Maximum：空
           CharacterEncoding：UTF-8           

目前只能实现一对一的转换

怎样才能实现批量转换呢？

Answer 1

结合GPT给出回答如下请题主参考
批量转换文件格式是一项非常常见的任务，可以通过编写代码来实现这个功能。下面我将详细介绍如何使用Python编写一个程序来实现批量转换文件格式的功能。

首先，我们需要准备一些必要的工具和库，包括Python的os和shutil库。os库提供了访问文件系统的功能，shutil库提供了文件操作的功能。

import os
import shutil

接下来，我们需要确定要转换的文件夹路径和目标格式。假设要将文件夹中的所有图片文件转换为JPEG格式，我们可以将文件夹路径设置为source_folder，目标格式设置为target_format。例如：

source_folder = '/path/to/source/folder'
target_format = 'JPEG'

然后，我们可以使用os库中的listdir函数获取文件夹中的所有文件名，并使用os库中的join函数将文件名与文件夹路径拼接起来，得到文件的完整路径。然后，我们可以使用os库中的isfile函数判断路径对应的文件是否为一个文件（而不是文件夹），这样可以排除文件夹路径的情况。

for file_name in os.listdir(source_folder):
    file_path = os.path.join(source_folder, file_name)
    if os.path.isfile(file_path):
        # 转换文件格式的代码将在这里添加

接下来，我们需要判断文件的格式是否与目标格式一致。我们可以使用os库中的splitext函数获取文件的后缀名，然后将其与目标格式进行比较。如果两者不一致，我们就需要对文件进行转换。

if os.path.splitext(file_name)[1] != '.' + target_format:
    # 转换文件格式的代码将在这里添加

接下来，我们需要确定输出文件的路径和名称。我们可以使用os库中的splitext函数获取文件的基本名称（即去掉文件后缀的部分），然后将其与目标格式进行拼接，得到输出文件的完整路径。

output_file = os.path.splitext(file_name)[0] + '.' + target_format
output_path = os.path.join(source_folder, output_file)

最后，我们可以使用shutil库中的move函数移动文件到新的路径，从而实现文件格式的转换。

shutil.move(file_path, output_path)

将上述代码整合在一起，我们可以得到一个完整的文件格式转换程序：

import os
import shutil

source_folder = '/path/to/source/folder'
target_format = 'JPEG'

for file_name in os.listdir(source_folder):
    file_path = os.path.join(source_folder, file_name)
    if os.path.isfile(file_path) and os.path.splitext(file_name)[1] != '.' + target_format:
        output_file = os.path.splitext(file_name)[0] + '.' + target_format
        output_path = os.path.join(source_folder, output_file)
        shutil.move(file_path, output_path)

使用这个程序，你可以将指定文件夹中的所有图片文件转换成JPEG格式。需要注意的是，这个程序只支持图片文件的转换，如果需要处理其他类型的文件，你可能需要使用不同的库和方法。

希望以上的代码和解释能够帮助你实现批量转换文件格式的功能。如果你有任何问题，欢迎再次向我提问！