SMR合并多个文件报错

Question

各位精英，我在用SMR合并22条染色体的mqtl文件，所有的besd、esi、epi文件都放在一个文件夹里，按官网的命令执行后报错如图，这个是什么情况？怎么解决？谢谢

Answer 1

引自免费微信小程序：皆我百晓生

根据您提供的错误信息，问题似乎在于程序无法打开特定的文件，具体是 bl_mqtl_lite_chrl.esi。错误可能是由于以下原因之一导致的：

1. 文件路径或文件名错误：确保您提供的文件路径和文件名是正确的。特别是注意文件名中的空格和特殊字符，有时候这些可能导致问题。例如，您提供的错误中 chrl 是否应该是 chr1 的一个拼写错误？检查您的 .list 文件和所有相关的文件，确保它们都在正确的位置并且名称正确无误。
2. 文件权限问题：可能是由于程序没有足够的权限来访问该文件。请检查文件的权限设置，确保运行SMR的程序有足够的权限来读取该文件。
3. 文件缺失或损坏：确保所有必要的文件都存在于指定的位置，并且没有损坏。如果可能的话，尝试重新获取或生成缺失的文件。

为了解决这个问题，您可以尝试以下步骤：

• 检查 my_file.list 文件中的文件名是否正确，特别是 bl_mqtl_lite_chrl.esi 这一项。确保文件名没有拼写错误或格式错误。
• 确保所有文件都在正确的文件夹中，并且文件夹路径正确无误。
• 检查文件的权限设置，确保运行SMR的程序有足够的权限来读取文件。
• 重新检查SMR的官方文档或教程，确认您是否按照正确的步骤进行操作。

如果您能提供更多关于您的文件结构和命令执行的详细信息，我可能能提供更具体的帮助。另外，如果SMR有官方支持渠道（如论坛或邮件支持），您也可以尝试在那里寻求帮助。