企画 2024-10-18 16:13 采纳率: 14.3%
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想查看化学反应信息和专利信息,有什么资源推荐?

在查看相关化学物质的时候,想知道其化学反应信息以及一些专利信息。最好能够模糊检索的。

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  • 达瓦里氏123 2024-10-18 16:15
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    化学反应数据库对于实验人员设计合成路线具有很高的价值,尤其在有机化学领域中显得尤为重要。化学反应数据库作为化学研究和工业应用中不可或缺的资源,不仅极大地提升了实验人员设计合成路线的效率,促进了化学知识的积累与传承,还激发了创新思维,推动了化学科学的进步,同时为教育工作者和学生提供了丰富的学习材料,帮助企业优化生产流程,开发新产品,并通过安全性评估减少了实验风险,促进了跨学科的研究与合作,支持了数据驱动的科学决策,加强了国际间的学术交流,鼓励了全球范围内的知识共享与合作,对化学及相关领域的研究和发展产生了深远的影响。

    在互联网尚未普及的年代,化学文摘社(CAS)已经对文献中的化学反应进行了索引。目前,这些数据可以通过SciFinder进行访问,它包含了来自期刊、专利、书籍等来源的化学信息和书目资料。然而,SciFinder 以及类似的商业数据库 Reaxys 无法批量导出大量化合物和化学反应数据,这限制了深度 ML 所需的训练数据集的大小。为了解决这一问题,研究人员开始利用文本处理技术,从美国专利商标局(USPTO)公开的专利中提取反应信息,这些信息可以免费从互联网上获取。最近,开放反应数据库(ORD)制定了一种化学反应数据存储的模板,旨在促进公共化学反应数据集的共享。

    • Reaxys数据库
      【网址】:https://www.reaxys.com/
      Reaxys数据库是目前最大的化学数据库,其收录的数据范围涵盖有机合成、药物化学、天然产物化学、无机化学和金属有机化学,并将化学反应,化合物物性数据,合成线路设计进行无缝对接,使科技检索工作更加高效、精准,并以其强大的检索功能和深入的核心信息摘录为化学研究注入新的生机。Reaxys 将十多亿个化学数据点与人工智能相结合,为药物发现、化学研发和学术界的创新提供支持。化学家可以快速获取相关的专利、物质和生物活性见解以及屡获殊荣的逆合成工具。Reaxys在Beilstein基础上整合了盖墨林(Gmelin)和专利化学数据库(PCD)以及化学相关期刊的内容,能帮助科研人员快速全面地查询化合物的理化数据,设计经济、高效的合成路线,最大程度节省时间和资金成本。 其收录的数据范围涵盖有机合成、药物化学、天然产物化学、无机化学和金属有机化学,并将化学反应,化合物物性数据,合成线路设计进行无缝对接,使科技检索工作更加高效、精准,并以其强大的检索功能和深入的核心信息摘录为化学研究注入新的生机。在进行结构式检索时,Reaxys 提供了多种检索模式和工具,以帮助用户精确地找到所需的化合物和反应信息。
    • CAS SciFindern数据库
      【网址】:https://scifinder-n.cas.org/
      CAS SciFindern由美国化学会(American Chemical Society, ACS)旗下的美国化学文摘社(Chemical Abstracts Service, CAS)出品,是一个研发应用平台,提供全球最大、最权威的化学及相关学科文献、物质和反应信息。综合了全球200多个国家和地区的60多种语言的1万多份期刊,内容丰富全面,用户可以通过主题、分子式、结构式和反应式等多种方式进行检索。该平台汇集了180多个国家、50多种语言出版的文献及64家专利授权机构的专利,包含5900万化学及相关学科文献、2.04亿化学物质、1.5亿化学反应、139万来自专利的马库什结构、化学品商业信息及管控信息,最早回溯至1840年。
      CAS SciFindern的一大特色是可以提供专利马库什结构的机构。平台从全球64家专利机构的公开专利中提取了超过139万个可检索的马库什结构,一个马库什结构可能涵盖数千甚至数万个化合物,这大大增强了研发和知识产权专业人士在进行化合物结构的新颖性和创造性搜索、发现相似专利以及评估潜在侵权风险的能力。并且其中的CAS PatentPak模块在定位和分析大量专利中的化学结构方面,采用人工标引,检索人员可以快速识别专利中难以发现的物质(例如,表格化合物和图形图像内的化合物)。该平台的另一特色是其含有7.2亿生物序列,可进行FTO检索、侵权检索,可以更好的服务与研发人员及知识产权相关行业人士。CAS SciFindern数据库中还包括一个反应信息数据库CASReact,收集了各种反应与制备信息。
    • USPTO
      【网址】:https://www.uspto.gov/
      美国专利商标局( 简称 USPTO)通过其官方网站向公众发布美国专利申请及专利信息,以及提供专利及商标相关服务。 USPTO 官网提供的与专利相关信息与服务资源主要包括有专利检索系统:Patent Public Search;专利电子申请管理和查询系统:Patent Center;专利审判用户上诉委员会审查决定:PTAB Decisions; 专利权转移查询数据库:Patent Assignment Search;全球主要国家专利申请案卷信息查询数据库:Global Dossier; 专利公布电子版:Patent Official Gazette;以及专利序列数据库:Search Published Sequence 等。 其中,2022年USPTO 对专利信息检索工具进行了全面升级改造,在官网上线了全新的专利检索系统(Patent Public Search)和专利电子申请管理和查询系统(Patent Center), 向公众免费开放。
      Patent Public Search(PPUBS)是美国专利商标局全新推出的一个专利检索系统。系统中收录了美国授权专利数据(1976 年以来公布的所有文本数据,1790年以来公布的所有图像数据),和美国专利申请数据(2001 年—至今)。 用户无需注册就可以免费检索美国专利申请和授权专利文献。 Patent Center 是美国专利商标局开发的新一代专利电子申请的账户管理系统,集申请提交、查询和缴费管理等功能为一体的一站式平台。 以往公众可使用 Public-PAIR 查询美国专利申请相关公开信息,该系统于2022年7月下线,相关查询服务全部转入 Patent Center。公众无需注册,即可免费查询。 Patent Center 公众查询服务中,可以提供有关美国专利申请的详细法律状态信息和专利申请案卷文档,如:美国申请的基本信息、审查案卷电子文档和审批记录、继续申请和分案信息、专利权期限调整(PTA)信息、国外优先权信息、缴费记录、申请人和代理人信息、专利权转让记录和专利引文信息等。
    • ORD
      【网址】:https://github.com/open-reaction-database
      0RD(Open Research Dataset)是由亚马逊推出的一个免费开放的科学研究数据集。一种用于构建和共享有机反应数据的开放访问架构和基础设施(包括一个集中的数据存储库)。它包含超过2000万个科学论文摘要和全文的数据,覆盖了计算机科学、物理学、数学、生物学、医学、化学等多个学科领域。ORD的目标是提供给研究人员一个大规模的数据集,以便他们进行深入的研究和分析。
      开源反应数据库是一项支持机器学习以及反应预测、化学合成规划和实验设计相关工作的举措。目标是为化学反应数据提供结构化的数据格式,使数据免费和公开可用,鼓励共享竞争前的专有数据,并提供浏览/下载该数据的界面。一个关键示例是高通量反应筛选数据的标准化和共享。这一努力基于科学数据管理的FAIR原则。
      ORD 搜索界面用于在数据库中搜索反应。可以通过输入或输出分子的 SMILES/SMARTS 子结构、反应 ID、出版物 DOI 等查询反应。每个反应都有一个摘要页面,其中显示了完整记录以及图形示意图。我们还编写了一个简单的Python API,使下游用户能够以编程方式轻松访问数据。客户端库支持基于Web的搜索界面中的所有搜索功能,以及下载完整数据集或反应列表的功能。
      解析ORD数据集时,你可以按照不同的科学领域进行分类,选择你感兴趣的领域进行研究。你可以使用关键词功能,快速找到和你研究主题相关的论文。在使用ORD进行科学研究时,你可以使用机器学习和自然语言处理的技术对数据进行分析。除此之外,你还可以使用其他的数据分析方法进行研究。
      在使用ORD进行科学研究时,你需要注意一些限制和注意事项。首先,ORD数据集只包含论文的摘要和全文,不包含其他相关数据,比如实验数据和图表。其次,0RD数据集的使用受到版权和使用条款的限制,你需要遵守相关的规定。最后,由于0RD数据集的规模较大,你需要有足够的计算资源和时间进行处理和分析。
    • MolAid
      【网址】:https://chem.molaid.com/home
      MolAid作为国内领先的多终端化合物检索及智能一体化数字合成平台,收录全球数以亿计的化合物数据,提供精准数据信息。MolAid打破化学数据垄断,让用户摆脱数据库不稳定、高查询成本等烦恼,为中国科研工作者提供专业的物质查询、反应检索,助力中国化学合成发展。
      MolAid为用户提供多种查询化合物信息方式,包括通过名称、CAS、化学式或者SMILES等常用编码进行搜索,还支持绘制结构以及高级检索方法(比如:谱图反向查询化合物、晶体信息反向查询以及根据化合物物化性质等特征信息进行逻辑符连接)。MolAid多样的化合物检索方式,确保用户每次一检索都能获取有价值的信息。为我们提供化合物作为反应物、产物、试剂、溶剂及催化剂的所有已发表文献和专利中的反应信息,使我们能够清楚快捷的查询到需要的反应信息及期刊信息。考虑到每个实验室条件,设备及贮存的化合物不同,MolAid他们将反应物、产物、溶剂、试剂、催化剂、产率、年份、来源等数据均做了聚类处理,方便我们更快捷的找到反应中适用的化合物。
    • chemspider
      【网址】:http://www.chemspider.com/
      ChemSpider是由英国皇家化学会(RSC)提供的一个免费化学物质数据库,收录1亿多种化学品的信息,包括其结构、物理化学性质、生物学性质、2D和3D结构示意图、物质合成的路线、参考文献等多种信息,可下载mol格式的结构源文件等。 ChemSpider通过聚合多个来源的数据,提供了一个广泛的化学物质检索平台,对科研人员和教育工作者比较有用。现在,该数据库含有的信息包括海洋天然产物数据、ACD实验室化学数据库、EPA的DSSTox数据库以及来自不同供应商的一系列化学物质信息。数据库拥有多种搜索工具,而且大多数化合物都有计算物理化学性质值的。
      ChemSpider中收录了数百万种有机、无机和生物分子的结构、属性和相关信息。用户可以通过搜索、浏览和互动来获取有关化合物的详细信息,包括分子结构、物理化学性质、光谱数据、毒性信息等。这个平台可以帮助研究人员在化学研究、药物开发、环境科学等领域找到所需的数据和信息。
      数据库提供以下查询方式:标准查询方式包括系统名称、商业名称和同义词、登记号查询;高级查询方式提供互动式搜索,通过化合物结构、化合物子结构,分子式以及分子量、CAS编号搜索。

    查询合成路线/人名反应 还有以下网站:
    https://www.nextmovesoftware.com/about.html
    http://www.stolaf.edu/depts/chemistry/courses/toolkits/247/practice/medialib/data/
    http://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/
    http://www.organic-chemistry.org/reactions.htm
    http://chemistrybydesign.oia.arizona.edu/
    https://organicchemistrydata.org/hansreich/resources/syntheses/
    https://www.masterorganicchemistry.com/reaction-guide/

    希望自己的推荐对你有所帮助~

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  • 创建了问题 10月18日