如何在ubuntu中下载rdkit

Question

我想在ubuntu18.04中以python2.7下载rdkit要如何操作，尝试了各种方法一直不成功，求指教

Answer 1

♥ 该回答参考ChatGPT，由吾为汝整理提供，如若有用，还请题主采纳！♥

在 Ubuntu 18.04 中安装 RDKit（尤其是针对 Python 2.7）可以通过以下步骤进行。请注意，RDKit 的支持主要集中在 Python 3.x 上，因此建议尽量使用 Python 3.x。如果你确实需要 Python 2.7，以下是安装步骤：

步骤 1: 安装依赖项

首先，确保你的系统是最新的，并安装必要的依赖项：

sudo apt-get update
sudo apt-get install -y build-essential python2.7 python2.7-dev python-pip \
    libboost-all-dev libeigen3-dev libpng-dev libjpeg-dev libtiff-dev \
    libxml2-dev libxslt1-dev libsqlite3-dev libboost-python-dev \
    libopenbabel-dev

步骤 2: 安装 RDKit

接下来，你可以通过 conda 来安装 RDKit。首先，你需要安装 Anaconda 或 Miniconda。以下是安装 Miniconda 的步骤：

# 下载 Miniconda 安装脚本
wget https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda2-latest-Linux-x86_64.sh

# 运行安装脚本
bash Miniconda2-latest-Linux-x86_64.sh

# 按照提示完成安装

安装完成后，重启终端或运行以下命令以激活 conda：

source ~/miniconda2/bin/activate

步骤 3: 创建 Python 2.7 环境并安装 RDKit

使用 conda 创建一个新的 Python 2.7 环境，并安装 RDKit：

# 创建一个新的 conda 环境，命名为 rdkit_env
conda create -n rdkit_env python=2.7

# 激活环境
conda activate rdkit_env

# 安装 RDKit
conda install -c conda-forge rdkit

步骤 4: 验证安装

安装完成后，你可以通过以下命令验证 RDKit 是否成功安装：

python -c "from rdkit import Chem; print(Chem.__version__)"

如果没有错误并且输出了 RDKit 的版本号，说明安装成功。

注意事项

• RDKit 在 Python 2.7 上的支持可能会逐渐减少，建议尽量使用 Python 3.x。
• 如果在安装过程中遇到问题，请确保你的网络连接正常，并检查错误信息以获取更多线索。

（如若有用，还请题主采纳！）