MIMIC数据库安装问题

Question

在安装MIMIC数据库时出现错误，请教各位！
mimiciv=# \i F:/mimic-iv/mimic-code-main/mimic-iv/buildmimic/postgres/load_7z.sql
psql:F:/mimic-iv/mimic-code-main/mimic-iv/buildmimic/postgres/load_7z.sql:7: 错误: \cd: 无法切换目录至 "F:/mimic-iv/mimiciv-data/mimic-iv-1.0": No such file or directory
SET
psql:F:/mimic-iv/mimic-code-main/mimic-iv/buildmimic/postgres/load_7z.sql:13: 错误: \cd: 无法切换目录至 "hosp": No such file or directory
ERROR: 系统找不到指定的文件。
admissions.csv.gz
System ERROR:
系统找不到指定的文件。

Answer 1

题主您好，本回答参考AIGC,并由本人整理提供，如问题解决，望采纳；如仍有疑问，请评论回复。

在安装MIMIC数据库时遇到的错误提示表明，PostgreSQL无法找到指定的目录或文件。以下是一些可能的解决方案和检查步骤：

1. 确认路径正确性：

   • 请确保 F:/mimic-iv/mimiciv-data/mimic-iv-1.0 和 hosp 目录确实存在。如果这些目录不存在，请检查下载的数据集是否完整，或者重新下载数据集。

2. 检查文件是否存在：

   • 确保 admissions.csv.gz 文件存在于正确的目录中。如果文件缺失，可能需要重新下载或从备份中恢复。

3. 权限问题：

   • 确保你有足够的权限访问这些目录和文件。可以尝试以管理员身份运行命令行工具。

4. 路径格式：

   • 在Windows系统中，路径分隔符是反斜杠（\），但在SQL脚本中通常使用正斜杠（/）。尝试将路径中的反斜杠替换为正斜杠，例如：

     \cd F:/mimic-iv/mimiciv-data/mimic-iv-1.0
     

5. 环境变量：

   • 确保你的系统环境变量中包含PostgreSQL的路径，以便能够正确执行相关命令。

6. 手动创建目录：

   • 如果目录不存在，可以手动创建这些目录，然后再次运行脚本。例如：

     mkdir -p F:/mimic-iv/mimiciv-data/mimic-iv-1.0/hosp
     

7. 日志和调试信息：

   • 查看完整的错误日志，可能会提供更多关于问题的线索。

8. 重新安装：

   • 如果以上方法均无效，考虑重新下载并解压MIMIC数据集，然后重新运行安装脚本。

以下是一个示例脚本，假设你已经下载并解压了MIMIC数据集：

-- 切换到数据目录
\cd F:/mimic-iv/mimiciv-data/mimic-iv-1.0

-- 加载数据
\i load_7z.sql

希望这些建议能帮助你解决问题。如果问题依然存在，请提供更多的错误信息或上下文，以便进一步诊断。