如何分割一个pt文件的所有的图的数据

Question

已知到一个pt文件
该文件是个图的集合体，就是说所有生成图像的原始数据都在一起，分成组的，但我想要跑通这个文件，可是不知道该如何分解这个数据。
(Data(x=[17299, 5], edge_index=[2, 351108], pos=[17299, 3], element=[1491], z=[17299], dist=[351108], y=[1491, 1062], batch=[17299], ptr=[1492]), defaultdict(<class 'dict'>, {'x': tensor([ 0, 11, 21, ..., 17263, 17281, 17299]), 'edge_index': tensor([ 0, 110, 200, ..., 350496, 350802, 351108]), 'pos': tensor([ 0, 11, 21, ..., 17263, 17281, 17299]), 'element': tensor([ 0, 1, 2, ..., 1489, 1490, 1491]), 'z': tensor([ 0, 11, 21, ..., 17263, 17281, 17299]), 'dist': tensor([ 0, 110, 200, ..., 350496, 350802, 351108]), 'y': tensor([ 0, 1, 2, ..., 1489, 1490, 1491])}))
这个是数据集的结构。
有没有哪位专家可以帮忙解决，十分感谢。

Answer 1

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解决方案

你遇到的问题是要从一个.pt文件中分割出所有的图的数据。这个文件是一个 PyTorch 的数据集，包含了图的原始数据。

可以使用 PyTorch 的 torch.load 函数来加载这个文件，然后使用 data_list 变量来存储每个图的数据。

下面是一个示例代码：

import torch

# 加载 pt 文件
data = torch.load('your_data.pt')

# 获取数据列表
data_list = []

# 遍历数据
for i in range(len(data)):
    # 获取当前图的数据
    graph_data = data[i]
    # 将数据添加到列表中
    data_list.append(graph_data)

# 打印数据列表
print(data_list)

这个代码将加载 .pt 文件，然后遍历数据，获取每个图的数据，并将其添加到 data_list 列表中。

如果你想要批量处理这些数据，可以使用 batch 函数来将数据分割成小批量，然后对每个批量进行处理。

例如：

import torch

# 加载 pt 文件
data = torch.load('your_data.pt')

# 设置批量大小
batch_size = 32

# 遍历数据
for i in range(0, len(data), batch_size):
    # 获取当前批量的数据
    batch_data = data[i:i+batch_size]
    # 对每个批量进行处理
    for graph_data in batch_data:
        # 处理图的数据
        # ...

这个代码将加载 .pt 文件，然后遍历数据，使用 batch_size 变量来将数据分割成小批量，然后对每个批量进行处理。

希望这个解决方案能够帮助你解决问题！