生信：conda安装的软件无法调用。

Question

通过conda创建了一个新的虚拟环境，然后再这个虚拟环境中，使用命令“conda install -c busco”下载软件“busco”，但是在后续的检查软件是否安装好时，发现，并不能正常使用软件。我自己分析的原因是：可能conda安装的软件，并不会自动帮你写环境变量，所以无法调用软件。但是自己不知道怎么解决。

Answer 1

首先我用你贴的命令执行之后，也没安装成功

如果你确定安装成功的话，安装下面的步骤进行排查

1. 检查 busco 是否安装成功 pip list| grep busco
2. 检查是否生成执行文件 ls -l /home/ms/anaconda3/envs/test/bin | grep busco

安装成功的话，上面两个命令都会输出busco

如果没有安装成功的话，可以自行下载 busco进行安装，
这里有步骤
https://busco.ezlab.org/busco_userguide.html#supported-os https://busco.ezlab.org/busco_userguide.html#supported-os

我在安装的时候会提示

copying build/scripts-3.9/busco -> /home/sanmu/miniconda/envs/test/bin
changing mode of /home/sanmu/miniconda/envs/test/bin/busco to 775

这就是把执行文件创建好了，所以可以正常运行