STM32f10x.h是芯片寄存器头文件，就像51单片机的reg51.H。基本上所有涉及到控制单片机的c程序都要包含。
至于SYS.H 我猜你用的是原子的库，里边就4条函数看你需要。
void WFI_SET(void); //执行WFI指令
void INTX_DISABLE(void);//关闭所有中断
void INTX_ENABLE(void); //开启所有中断
void MSR_MSP(u32 addr); //设置堆栈地址
里边还有IO口操作宏定义，如果你想像51一样操作io口就用吧。
一般情况这两个头文件都会包含。

这个好像是系统时钟里面的

可以去查查手册中的系统定时器

STM32f10x.h就是定义的一些宏定义，寄存器名称什么的，库函数的说明里面一般都有，下面是我截下的注解说明：

• @file stm32f10x.h
• @author MCD Application Team
• @version V3.5.0
• @date 11-March-2011
• @brief CMSIS Cortex-M3 Device Peripheral Access Layer Header File.
• This file contains all the peripheral register's definitions, bits
• definitions and memory mapping for STM32F10x Connectivity line,
• High density, High density value line, Medium density,
• Medium density Value line, Low density, Low density Value line
• and XL-density devices. *
• The file is the unique include file that the application programmer
• is using in the C source code, usually in main.c. This file contains:
• - Configuration section that allows to select:
• - The device used in the target application
• - To use or not the peripheral’s drivers in application code(i.e.
• code will be based on direct access to peripheral’s registers
• rather than drivers API), this option is controlled by
• "#define USE_STDPERIPH_DRIVER"
• - To change few application-specific parameters such as the HSE
• crystal frequency
• - Data structures and the address mapping for all peripherals
• - Peripheral's registers declarations and bits definition
• - Macros to access peripheral’s registers hardware

你编译后在用到这两个头文件的C文件中找到.h的源文件，看这两个头文件中定义了哪些变量及声明了哪些函数，看你用到了没有，没有的话注释掉就好了，第一个应该是工程启动文件，第二个应该是用的开发库定义的文件。