r语言中sqrt和as.matrix

Question

我要做AMOVA分析 需要欧式矩阵 用as.matrix做出了个矩阵

as.matrix(data[distances])[1:20,1:20]

然后用amovapro <- amova(samples = data[protist], distances = sqrt(data[distances]), structures = data[structures])

错误为Object of class 'dist' expected for distances

如果把sqrt(data[distances])改为sqrt(data$distances) 就是数学函数中用了非数值参数

我知道问题可能是出在 之前的 distances < -()  

求教如何能将distances变为数值参数 或者as.matrix的原始数据录入格式应该是怎么样的呢

Answer 1

以下回答参考 皆我百晓生、券券喵儿 等免费微信小程序相关内容作答，并由本人整理回复。

sqrt() 函数接受一个数值或者向量作为输入。如果你想要使用 sqrt() 函数来计算距离矩阵，你需要首先将其转换成数值形式。

你可以通过以下方式实现：

# 创建一个距离矩阵
data(distances)

在这个例子中，distances 是一个向量，其中每个元素都是两个向量之间的欧氏距离。为了使用 sqrt() 函数，我们需要将其转换为数值形式。这可以通过使用 as.numeric() 函数来完成。

例如：

# 转换距离矩阵到数值形式
data(distances) <- as.numeric(data(distances))

现在，distances 应该是一个数值矩阵，你可以继续使用 sqrt() 函数来计算距离矩阵了。