用clusterProfiler作KEGG富集分析时,我用KAAS里注释的KO号和基因作背景基因集,用的是GENG id 的格式,我的差异基因也是同样的格式,富集过程报错,显示未富集到,Expected input gene ID: 122924720 ,122933819 ,122941295 ,122931065 ,122935307 ,122935929 ,调整了参数仍就不对
x <- enricher(Ugene,TERM2GENE=ko2gene,TERM2NAME=ko2name,pvalueCutoff = 0.05,
- pAdjustMethod = "BH",qvalueCutoff = 0.2)
--> No gene can be mapped
--> Expected input gene ID: 122924720 ,122933819 ,122941295 ,122931065 ,122935307 ,122935929
--> return NULL
ID切换,不成功
希望找到原因,解决问题