GEO下载数据的处理报错 ：函数‘Meta’标签‘"data.frame"’找不到继承方法，如何解决？

Question

小白论文数据处理初尝试：进行GEO下载数据的处理，出现报错 Error in (function (classes, fdef, mtable) : 函数‘Meta’标签‘"data.frame"’找不到继承方法 。

代码和报错如下：

#下载数据和注释
eset<-geoChina('GSE131793')
ann_info <-getIDs('GPL6244')
#获取表达矩阵
eset
eset<-eset[[1]]
probe_exp <- exprs(eset) 
dim(probe_exp)
data_use <- as.data.frame(probe_exp)
#获取注释信息
Meta(ann_info)$title
anno_geoquery<-Table(ann_info)

> Meta(ann_info)$title
Error in (function (classes, fdef, mtable)  : 
  函数‘Meta’标签‘"data.frame"’找不到继承方法

我猜测是因为包未加载，但是使用conflicted包，和指定包的办法都未解决。

求帮助！

Answer 1

我觉得可能是由于没有安装并正确加载"GEOquery"包导致的
检查一下你的包

install.packages("GEOquery")
library(GEOquery)

我写过一篇文章关于对geo数据处理的：https://blog.csdn.net/qq_62932195/article/details/128742414?spm=1001.2014.3001.5502