star_cyan 2023-02-19 08:32 采纳率: 0%
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关于KEGG气泡图分析

关于气泡图分析(KEGG气泡图)

求问各位,我有几个通路的pvalue为0,做出来的泡泡是灰色的,请问这是不是说明这灰泡泡比红泡泡更具有相关性呢?(主要看了一些论文,没有发现有这种情况的)

这些灰泡泡所在的通路需要删去吗?

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  • qq_46161207 2023-02-19 09:38
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    在KEGG气泡图中,泡泡的颜色表示通路的显著性,即p-value的大小,通常红色泡泡表示显著差异,而灰色泡泡则表示未显著差异。因此,如果您的分析结果中出现了p-value为0的通路,那么对应的泡泡就会变成灰色的。这并不意味着灰色泡泡比红色泡泡更具有相关性,而是说明这些通路在您的样本中没有显著差异。

    关于这些灰色泡泡所在的通路是否需要删去,这需要根据具体的研究问题和数据特点来考虑。如果这些通路和您的研究问题无关,可以将其删除;如果这些通路和您的研究问题有关,可以考虑在后续的分析中结合其他数据和实验结果进行综合分析。

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