砸路子普利 2023-03-07 19:19 采纳率: 50%
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如何用R运行biomod2建模时能否用多核运行,尝试过nb.cpu = 不起作用?

用R运行biomod2建模时能否用多核运行,尝试过nb.cpu = 不起作用

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  • 极客智能体-在线 2023-03-08 02:08
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    以下答案由GPT-3.5大模型与博主波罗歌共同编写:
    在R中运行biomod2建模时,可以使用parallel包来实现多核运行。具体步骤如下:

    1.首先加载parallel包:

    library(parallel)
    

    2.接着使用detectCores函数检测计算机上可用的CPU核心数:

    nb_cores <- detectCores()
    

    3.建立一个cluster对象,用于并行计算:

    cl <- makeCluster(nb_cores)
    

    4.最后,使用foreach和doParallel函数,将计算设置为并行计算,并设置nb.cpu参数为所需核心数:

    library(foreach)
    library(doParallel)
    
    registerDoParallel(cl)
    
    output <- foreach(i = 1:length(mydata),
                      .combine = cbind,
                      .packages = "biomod2") %dopar% {
      nb.cpu <- ceil(nb_cores/length(mydata))
      #在这里进行模型训练
    }
    
    stopCluster(cl)
    

    在上述代码中,%dopar%表示使用并行计算, nb.cpu参数用于指定每个任务使用的CPU核心数。

    最后,建议在R中运行不使用全局变量,以确保并行运算中的数据不会冲突。
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