2301_77026894 2023-03-15 00:35 采纳率: 80%
浏览 93
已结题

SingleR运行报错怎么解决呢

###开始用singler分析

cellpred
<-
SingleR(test
= testdata.
ref = refdata, labels = refdata$label.main,
+
method
=
"cluster"
clusters = clusters,
+
assay.type.test
=
"logcounts
assay.type.ref =
"loqcounts")
Error: BiocParallel errors
1 remote errors, element index: 1
4 unevaluated and other errors
first remote error:
Error in validityMethod (as (object, superClass)): object
"CsparseMatrix_validate' not found
In addition: warning message:
"method-"cluster"
is no longer necessary when 'cluster='
is specified
◎捚袁

  • 写回答

1条回答 默认 最新

  • threenewbee 2023-03-15 10:06
    关注

    validityMethod这里报错了,CsparseMatrix_validate没有找到。

    本回答被题主选为最佳回答 , 对您是否有帮助呢?
    评论

报告相同问题?

问题事件

  • 系统已结题 5月27日
  • 已采纳回答 5月19日
  • 创建了问题 3月15日