像这种只有一个这个
而没有这样三个文件
还可以用R 分析吗 用什么代码能创建seraut 对象呢
创建seraut 对象
而没有这样三个文件
还可以用R 分析吗 用什么代码能创建seraut 对象呢
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关注单细胞数据有多种形式，图二中三个文件这是标准的10x，图一这个单个矩阵的话直接读入数据转换为矩阵avereps去重后CreateSeuratObject就行了
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- 2022-04-11 22:27生信小博士的博客 library(CellChat) library(Seurat) library(dplyr) library(patchwork) library(ggplot2) library(ggalluvial) library(svglite) library(Seurat) library(openxlsx) library(harmony) library(DoubletFinder) ...
- 2022-03-10 23:53今天也是个妖精头子呀的博客 首先，文件夹下应该存在三个文件，分别命名为： barcodes.tsv.gz matrix.mtx.gz features.tsv.gz 然后使用Seurat包中的，Read10X方法读取。 library(Seurat) data<-CreateSeuratObject(Read10X("./"),"ACC") ...
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- 2025-04-23 15:44sunny_dayone的博客 目录 数据 基础分析 一、数据导入 1、安装包 2、 导入数据 3、创建Seurat对象（用于存储单细胞测序数据及其分析结果） 二、预处理 1、质控分析 2、数据归一化 3、 特征筛选 4、标准化和缩放数据 5、降维 5.1线性...
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- 2013-12-23 00:31Tracy数据的博客 比如你有一个对象是车，那么你就有这些插槽：“价格”，“门的数量”，“发动机类型”，“里程数”。 举例如下： 新建： setClass ( "Car" , representation = representation ( price = ...
- 2024-08-24 23:45凑齐六个字吧的博客 已存在Seurat5版本 .libPaths() # /Library/Frameworks/R.framework/Versions/4.4-arm64/Resources/library # 创建目录安装V4 dir.create("/Library/Frameworks/R.framework/Versions/4.4-arm64/Resources/seurat4...
- 2021-01-06 18:35weixin_39534149的博客 - Read10X(data.dir = "pbmc3k_filtered_gene_bc_matrices/filtered_gene_bc_matrices/hg19")</code></pre></div><p>创建Seurat对象</p><div class="has"><pre class="has"><code>pbmc <- CreateSeuratObject...
- 2022-04-14 19:23生信小博士的博客 Seurat DefaultAssay "integrated" or "RNA" with integrated dataset???? I have a vehicle vs. treatment dataset that I am working through and came across the following in the Seurat vignette that I don'...
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- 2020-12-29 00:17薿瑊珩翯的博客 [7] <span>"BatchG-ACTGTCTAACGG" <span>"BatchH-TATCACATCGGT" <span>"bad_struct" [10] <span>"no_match" <span>"total_reads" <br /></code></pre>创建Seurat对象，并添加HTO数据。...
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4月6日