进行NRI分析时报错

Question

遇到的现象和发生背景，请写出第一个错误信息

计算NRI和IDI，输入以下代码后报错

用代码块功能插入代码，请勿粘贴截图。 不用代码块回答率下降 50%

logistic.model.list <- 
  list(Basic_model=model_r, 
       New_model=model_ra)
reclassification(data =imputed_right, cOutcome = 1, 
                 predrisk1 = fitted(logistic.model.list[["Basic_model"]]), 
                 predrisk2 = fitted(logistic.model.list[["New_model"]]), 
                 cutoff = c(0, 0.30, 1))

运行结果及详细报错内容

我的解答思路和尝试过的方法

用as.factor将结局变量x1因子化，再次运行NRI分析的代码，依然是同样的报错

请问如何解决

Answer 1

根据您提供的信息，第一个错误信息是：

"Error in improveProb(x1 = as.numeric(c11) * (1/(length(levels(c11)))), y must have two values: 0 and 1"

此错误提示表明在计算NRI和IDI时出现了问题。根据错误信息，问题可能出现在输入数据中的因变量（y）的取值上。因变量应该是二分类的，即只包含0和1两个取值。

您提到尝试将结局变量（x1）使用as.factor函数转换为因子型，但仍然遇到相同的报错。为了解决这个问题，您可以进行以下操作：

1. 确认结局变量的取值：检查一下结局变量（x1）的取值范围，确保只包含0和1两个值。可以使用以下代码查看结局变量的类别数量：

   table(imputed_right$x1)
   

2. 检查数据类型：确保结局变量（x1）的数据类型是因子型（factor），可以使用以下代码将其转换为因子型：

   imputed_right$x1 <- as.factor(imputed_right$x1)
   

3. 确保数据完整：检查数据中是否存在缺失值或其他异常情况，确保数据完整并且每个观测都有正确的结局变量值。

4. 检查变量名：请确保代码中使用的变量名与数据集中的变量名一致。确保变量名的大小写和拼写都正确。

如果您仍然遇到相同的报错，请提供更多的代码和数据细节，以便我能够更深入地帮助您解决问题。